Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS7

XAB2, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XAB2Q9HCS7 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
XAB2Q9HCS7 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
XAB2Q9HCS7 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
XAB2Q9HCS7 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
XAB2Q9HCS7 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
XAB2Q9HCS7 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
XAB2Q9HCS7 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
XAB2Q9HCS7 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
XAB2Q9HCS7 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
XAB2Q9HCS7 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
XAB2Q9HCS7 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
XAB2Q9HCS7 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
XAB2Q9HCS7 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
XAB2Q9HCS7 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
XAB2Q9HCS7 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
XAB2Q9HCS7 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
XAB2Q9HCS7 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
XAB2Q9HCS7 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
XAB2Q9HCS7 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
XAB2Q9HCS7 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
XAB2Q9HCS7 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
XAB2Q9HCS7 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
XAB2Q9HCS7 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
XAB2Q9HCS7 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
XAB2Q9HCS7 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
XAB2Q9HCS7 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
XAB2Q9HCS7 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
XAB2Q9HCS7 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
XAB2Q9HCS7 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
XAB2Q9HCS7 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
XAB2Q9HCS7 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
XAB2Q9HCS7 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
XAB2Q9HCS7 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
XAB2Q9HCS7 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
XAB2Q9HCS7 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
XAB2Q9HCS7 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
XAB2Q9HCS7 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
XAB2Q9HCS7 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
XAB2Q9HCS7 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
XAB2Q9HCS7 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
XAB2Q9HCS7 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
XAB2Q9HCS7 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
XAB2Q9HCS7 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
XAB2Q9HCS7 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
XAB2Q9HCS7 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
XAB2Q9HCS7 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
XAB2Q9HCS7 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
XAB2Q9HCS7 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
XAB2Q9HCS7 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
XAB2Q9HCS7 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
XAB2Q9HCS7 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
XAB2Q9HCS7 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
XAB2Q9HCS7 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
XAB2Q9HCS7 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
XAB2Q9HCS7 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
XAB2Q9HCS7 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
XAB2Q9HCS7 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
XAB2Q9HCS7 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
XAB2Q9HCS7 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
XAB2Q9HCS7 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
XAB2Q9HCS7 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
XAB2Q9HCS7 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
XAB2Q9HCS7 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
XAB2Q9HCS7 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
XAB2Q9HCS7 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
XAB2Q9HCS7 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
XAB2Q9HCS7 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
XAB2Q9HCS7 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
XAB2Q9HCS7 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
XAB2Q9HCS7 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
XAB2Q9HCS7 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
XAB2Q9HCS7 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
XAB2Q9HCS7 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
XAB2Q9HCS7 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
XAB2Q9HCS7 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
XAB2Q9HCS7 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
XAB2Q9HCS7 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
XAB2Q9HCS7 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
XAB2Q9HCS7 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
XAB2Q9HCS7 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
XAB2Q9HCS7 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
XAB2Q9HCS7 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
XAB2Q9HCS7 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
XAB2Q9HCS7 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
XAB2Q9HCS7 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
XAB2Q9HCS7 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
XAB2Q9HCS7 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
XAB2Q9HCS7 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
XAB2Q9HCS7 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
XAB2Q9HCS7 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
XAB2Q9HCS7 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
XAB2Q9HCS7 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
XAB2Q9HCS7 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
XAB2Q9HCS7 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
XAB2Q9HCS7 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
XAB2Q9HCS7 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
XAB2Q9HCS7 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
XAB2Q9HCS7 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
XAB2Q9HCS7 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
XAB2Q9HCS7 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms