Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCJ6

VAT1L, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog-like, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1LQ9HCJ6 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
VAT1LQ9HCJ6 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
VAT1LQ9HCJ6 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
VAT1LQ9HCJ6 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
VAT1LQ9HCJ6 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
VAT1LQ9HCJ6 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
VAT1LQ9HCJ6 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
VAT1LQ9HCJ6 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
VAT1LQ9HCJ6 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
VAT1LQ9HCJ6 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
VAT1LQ9HCJ6 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
VAT1LQ9HCJ6 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
VAT1LQ9HCJ6 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
VAT1LQ9HCJ6 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
VAT1LQ9HCJ6 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
VAT1LQ9HCJ6 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
VAT1LQ9HCJ6 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
VAT1LQ9HCJ6 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
VAT1LQ9HCJ6 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
VAT1LQ9HCJ6 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
VAT1LQ9HCJ6 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
VAT1LQ9HCJ6 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
VAT1LQ9HCJ6 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
VAT1LQ9HCJ6 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
VAT1LQ9HCJ6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
VAT1LQ9HCJ6 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
VAT1LQ9HCJ6 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
VAT1LQ9HCJ6 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
VAT1LQ9HCJ6 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
VAT1LQ9HCJ6 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
VAT1LQ9HCJ6 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
VAT1LQ9HCJ6 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
VAT1LQ9HCJ6 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
VAT1LQ9HCJ6 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
VAT1LQ9HCJ6 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
VAT1LQ9HCJ6 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
VAT1LQ9HCJ6 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
VAT1LQ9HCJ6 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
VAT1LQ9HCJ6 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
VAT1LQ9HCJ6 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
VAT1LQ9HCJ6 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
VAT1LQ9HCJ6 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
VAT1LQ9HCJ6 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
VAT1LQ9HCJ6 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
VAT1LQ9HCJ6 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
VAT1LQ9HCJ6 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
VAT1LQ9HCJ6 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
VAT1LQ9HCJ6 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
VAT1LQ9HCJ6 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
VAT1LQ9HCJ6 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
VAT1LQ9HCJ6 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
VAT1LQ9HCJ6 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
VAT1LQ9HCJ6 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
VAT1LQ9HCJ6 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
VAT1LQ9HCJ6 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
VAT1LQ9HCJ6 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
VAT1LQ9HCJ6 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
VAT1LQ9HCJ6 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
VAT1LQ9HCJ6 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
VAT1LQ9HCJ6 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
VAT1LQ9HCJ6 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
VAT1LQ9HCJ6 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
VAT1LQ9HCJ6 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
VAT1LQ9HCJ6 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
VAT1LQ9HCJ6 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
VAT1LQ9HCJ6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
VAT1LQ9HCJ6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
VAT1LQ9HCJ6 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
VAT1LQ9HCJ6 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
VAT1LQ9HCJ6 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
VAT1LQ9HCJ6 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
VAT1LQ9HCJ6 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
VAT1LQ9HCJ6 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
VAT1LQ9HCJ6 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
VAT1LQ9HCJ6 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
VAT1LQ9HCJ6 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
VAT1LQ9HCJ6 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
VAT1LQ9HCJ6 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
VAT1LQ9HCJ6 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
VAT1LQ9HCJ6 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
VAT1LQ9HCJ6 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
VAT1LQ9HCJ6 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
VAT1LQ9HCJ6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
VAT1LQ9HCJ6 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
VAT1LQ9HCJ6 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
VAT1LQ9HCJ6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
VAT1LQ9HCJ6 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
VAT1LQ9HCJ6 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.35■■□□□ 1.81
VAT1LQ9HCJ6 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
VAT1LQ9HCJ6 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
VAT1LQ9HCJ6 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
VAT1LQ9HCJ6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
VAT1LQ9HCJ6 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
VAT1LQ9HCJ6 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
VAT1LQ9HCJ6 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
VAT1LQ9HCJ6 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
VAT1LQ9HCJ6 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
VAT1LQ9HCJ6 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
VAT1LQ9HCJ6 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
VAT1LQ9HCJ6 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms