Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC52

CBX8, Chromobox protein homolog 8, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX8Q9HC52 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CBX8Q9HC52 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CBX8Q9HC52 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CBX8Q9HC52 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CBX8Q9HC52 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CBX8Q9HC52 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CBX8Q9HC52 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CBX8Q9HC52 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CBX8Q9HC52 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CBX8Q9HC52 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CBX8Q9HC52 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CBX8Q9HC52 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CBX8Q9HC52 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CBX8Q9HC52 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CBX8Q9HC52 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CBX8Q9HC52 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CBX8Q9HC52 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CBX8Q9HC52 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CBX8Q9HC52 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CBX8Q9HC52 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CBX8Q9HC52 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CBX8Q9HC52 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CBX8Q9HC52 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CBX8Q9HC52 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CBX8Q9HC52 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CBX8Q9HC52 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CBX8Q9HC52 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CBX8Q9HC52 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CBX8Q9HC52 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CBX8Q9HC52 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CBX8Q9HC52 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CBX8Q9HC52 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CBX8Q9HC52 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CBX8Q9HC52 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CBX8Q9HC52 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CBX8Q9HC52 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CBX8Q9HC52 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CBX8Q9HC52 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CBX8Q9HC52 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CBX8Q9HC52 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CBX8Q9HC52 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CBX8Q9HC52 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CBX8Q9HC52 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CBX8Q9HC52 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CBX8Q9HC52 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CBX8Q9HC52 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CBX8Q9HC52 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CBX8Q9HC52 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CBX8Q9HC52 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CBX8Q9HC52 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CBX8Q9HC52 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CBX8Q9HC52 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CBX8Q9HC52 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CBX8Q9HC52 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CBX8Q9HC52 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CBX8Q9HC52 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CBX8Q9HC52 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CBX8Q9HC52 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CBX8Q9HC52 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CBX8Q9HC52 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CBX8Q9HC52 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CBX8Q9HC52 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CBX8Q9HC52 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CBX8Q9HC52 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CBX8Q9HC52 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CBX8Q9HC52 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CBX8Q9HC52 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CBX8Q9HC52 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CBX8Q9HC52 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CBX8Q9HC52 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CBX8Q9HC52 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CBX8Q9HC52 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CBX8Q9HC52 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CBX8Q9HC52 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CBX8Q9HC52 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CBX8Q9HC52 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CBX8Q9HC52 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CBX8Q9HC52 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CBX8Q9HC52 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CBX8Q9HC52 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CBX8Q9HC52 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CBX8Q9HC52 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CBX8Q9HC52 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CBX8Q9HC52 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CBX8Q9HC52 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CBX8Q9HC52 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CBX8Q9HC52 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CBX8Q9HC52 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CBX8Q9HC52 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CBX8Q9HC52 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CBX8Q9HC52 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CBX8Q9HC52 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CBX8Q9HC52 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CBX8Q9HC52 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CBX8Q9HC52 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CBX8Q9HC52 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CBX8Q9HC52 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CBX8Q9HC52 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CBX8Q9HC52 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CBX8Q9HC52 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms