Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBA0

TRPV4, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 4, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPV4Q9HBA0 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRPV4Q9HBA0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRPV4Q9HBA0 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRPV4Q9HBA0 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRPV4Q9HBA0 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TRPV4Q9HBA0 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRPV4Q9HBA0 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRPV4Q9HBA0 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRPV4Q9HBA0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRPV4Q9HBA0 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRPV4Q9HBA0 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TRPV4Q9HBA0 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRPV4Q9HBA0 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TRPV4Q9HBA0 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TRPV4Q9HBA0 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRPV4Q9HBA0 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TRPV4Q9HBA0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TRPV4Q9HBA0 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TRPV4Q9HBA0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TRPV4Q9HBA0 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRPV4Q9HBA0 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRPV4Q9HBA0 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRPV4Q9HBA0 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRPV4Q9HBA0 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TRPV4Q9HBA0 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TRPV4Q9HBA0 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRPV4Q9HBA0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRPV4Q9HBA0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRPV4Q9HBA0 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRPV4Q9HBA0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRPV4Q9HBA0 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRPV4Q9HBA0 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRPV4Q9HBA0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRPV4Q9HBA0 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRPV4Q9HBA0 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRPV4Q9HBA0 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TRPV4Q9HBA0 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRPV4Q9HBA0 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRPV4Q9HBA0 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TRPV4Q9HBA0 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TRPV4Q9HBA0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRPV4Q9HBA0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRPV4Q9HBA0 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRPV4Q9HBA0 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRPV4Q9HBA0 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRPV4Q9HBA0 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRPV4Q9HBA0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRPV4Q9HBA0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRPV4Q9HBA0 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRPV4Q9HBA0 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRPV4Q9HBA0 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRPV4Q9HBA0 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRPV4Q9HBA0 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRPV4Q9HBA0 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRPV4Q9HBA0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRPV4Q9HBA0 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRPV4Q9HBA0 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRPV4Q9HBA0 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRPV4Q9HBA0 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRPV4Q9HBA0 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRPV4Q9HBA0 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRPV4Q9HBA0 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRPV4Q9HBA0 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRPV4Q9HBA0 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRPV4Q9HBA0 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRPV4Q9HBA0 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRPV4Q9HBA0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRPV4Q9HBA0 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRPV4Q9HBA0 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRPV4Q9HBA0 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRPV4Q9HBA0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRPV4Q9HBA0 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRPV4Q9HBA0 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRPV4Q9HBA0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRPV4Q9HBA0 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRPV4Q9HBA0 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRPV4Q9HBA0 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRPV4Q9HBA0 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRPV4Q9HBA0 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRPV4Q9HBA0 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRPV4Q9HBA0 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRPV4Q9HBA0 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRPV4Q9HBA0 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRPV4Q9HBA0 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRPV4Q9HBA0 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRPV4Q9HBA0 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRPV4Q9HBA0 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRPV4Q9HBA0 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TRPV4Q9HBA0 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRPV4Q9HBA0 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TRPV4Q9HBA0 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRPV4Q9HBA0 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRPV4Q9HBA0 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRPV4Q9HBA0 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRPV4Q9HBA0 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRPV4Q9HBA0 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRPV4Q9HBA0 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRPV4Q9HBA0 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRPV4Q9HBA0 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRPV4Q9HBA0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms