Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7B2

RPF2, Ribosome production factor 2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPF2Q9H7B2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPF2Q9H7B2 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPF2Q9H7B2 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPF2Q9H7B2 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPF2Q9H7B2 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPF2Q9H7B2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPF2Q9H7B2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPF2Q9H7B2 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPF2Q9H7B2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPF2Q9H7B2 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPF2Q9H7B2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPF2Q9H7B2 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPF2Q9H7B2 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPF2Q9H7B2 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPF2Q9H7B2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPF2Q9H7B2 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPF2Q9H7B2 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPF2Q9H7B2 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
RPF2Q9H7B2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPF2Q9H7B2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPF2Q9H7B2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPF2Q9H7B2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPF2Q9H7B2 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPF2Q9H7B2 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPF2Q9H7B2 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPF2Q9H7B2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPF2Q9H7B2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPF2Q9H7B2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPF2Q9H7B2 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPF2Q9H7B2 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPF2Q9H7B2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPF2Q9H7B2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
RPF2Q9H7B2 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPF2Q9H7B2 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPF2Q9H7B2 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPF2Q9H7B2 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPF2Q9H7B2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPF2Q9H7B2 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPF2Q9H7B2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPF2Q9H7B2 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPF2Q9H7B2 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPF2Q9H7B2 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPF2Q9H7B2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPF2Q9H7B2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPF2Q9H7B2 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPF2Q9H7B2 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPF2Q9H7B2 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPF2Q9H7B2 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPF2Q9H7B2 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPF2Q9H7B2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPF2Q9H7B2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
RPF2Q9H7B2 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPF2Q9H7B2 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPF2Q9H7B2 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPF2Q9H7B2 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RPF2Q9H7B2 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RPF2Q9H7B2 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPF2Q9H7B2 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPF2Q9H7B2 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPF2Q9H7B2 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPF2Q9H7B2 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPF2Q9H7B2 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPF2Q9H7B2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPF2Q9H7B2 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPF2Q9H7B2 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPF2Q9H7B2 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPF2Q9H7B2 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPF2Q9H7B2 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPF2Q9H7B2 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPF2Q9H7B2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPF2Q9H7B2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPF2Q9H7B2 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPF2Q9H7B2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPF2Q9H7B2 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPF2Q9H7B2 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPF2Q9H7B2 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPF2Q9H7B2 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPF2Q9H7B2 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPF2Q9H7B2 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPF2Q9H7B2 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPF2Q9H7B2 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPF2Q9H7B2 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPF2Q9H7B2 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPF2Q9H7B2 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPF2Q9H7B2 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPF2Q9H7B2 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPF2Q9H7B2 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPF2Q9H7B2 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPF2Q9H7B2 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPF2Q9H7B2 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPF2Q9H7B2 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPF2Q9H7B2 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPF2Q9H7B2 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPF2Q9H7B2 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPF2Q9H7B2 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPF2Q9H7B2 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPF2Q9H7B2 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPF2Q9H7B2 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPF2Q9H7B2 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPF2Q9H7B2 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms