Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4I3

TRABD, TraB domain-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRABDQ9H4I3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRABDQ9H4I3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRABDQ9H4I3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRABDQ9H4I3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRABDQ9H4I3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRABDQ9H4I3 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRABDQ9H4I3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRABDQ9H4I3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRABDQ9H4I3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRABDQ9H4I3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRABDQ9H4I3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRABDQ9H4I3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRABDQ9H4I3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRABDQ9H4I3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRABDQ9H4I3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRABDQ9H4I3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRABDQ9H4I3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRABDQ9H4I3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRABDQ9H4I3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRABDQ9H4I3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRABDQ9H4I3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRABDQ9H4I3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRABDQ9H4I3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRABDQ9H4I3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRABDQ9H4I3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRABDQ9H4I3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRABDQ9H4I3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRABDQ9H4I3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRABDQ9H4I3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRABDQ9H4I3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRABDQ9H4I3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRABDQ9H4I3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRABDQ9H4I3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRABDQ9H4I3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRABDQ9H4I3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRABDQ9H4I3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRABDQ9H4I3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRABDQ9H4I3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRABDQ9H4I3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRABDQ9H4I3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRABDQ9H4I3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRABDQ9H4I3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TRABDQ9H4I3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRABDQ9H4I3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRABDQ9H4I3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRABDQ9H4I3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRABDQ9H4I3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRABDQ9H4I3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRABDQ9H4I3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRABDQ9H4I3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRABDQ9H4I3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRABDQ9H4I3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRABDQ9H4I3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TRABDQ9H4I3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRABDQ9H4I3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRABDQ9H4I3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRABDQ9H4I3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRABDQ9H4I3 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRABDQ9H4I3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRABDQ9H4I3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRABDQ9H4I3 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRABDQ9H4I3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRABDQ9H4I3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRABDQ9H4I3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRABDQ9H4I3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRABDQ9H4I3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TRABDQ9H4I3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRABDQ9H4I3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRABDQ9H4I3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRABDQ9H4I3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRABDQ9H4I3 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRABDQ9H4I3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRABDQ9H4I3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRABDQ9H4I3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRABDQ9H4I3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRABDQ9H4I3 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRABDQ9H4I3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRABDQ9H4I3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRABDQ9H4I3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRABDQ9H4I3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRABDQ9H4I3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRABDQ9H4I3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRABDQ9H4I3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRABDQ9H4I3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRABDQ9H4I3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRABDQ9H4I3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRABDQ9H4I3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRABDQ9H4I3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRABDQ9H4I3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRABDQ9H4I3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRABDQ9H4I3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRABDQ9H4I3 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRABDQ9H4I3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRABDQ9H4I3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRABDQ9H4I3 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRABDQ9H4I3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRABDQ9H4I3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRABDQ9H4I3 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRABDQ9H4I3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRABDQ9H4I3 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms