Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3Y6

SRMS, Tyrosine-protein kinase Srms, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRMSQ9H3Y6 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SRMSQ9H3Y6 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SRMSQ9H3Y6 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
SRMSQ9H3Y6 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRMSQ9H3Y6 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRMSQ9H3Y6 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRMSQ9H3Y6 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRMSQ9H3Y6 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRMSQ9H3Y6 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRMSQ9H3Y6 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRMSQ9H3Y6 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRMSQ9H3Y6 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRMSQ9H3Y6 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SRMSQ9H3Y6 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRMSQ9H3Y6 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRMSQ9H3Y6 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRMSQ9H3Y6 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRMSQ9H3Y6 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRMSQ9H3Y6 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRMSQ9H3Y6 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRMSQ9H3Y6 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRMSQ9H3Y6 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRMSQ9H3Y6 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRMSQ9H3Y6 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRMSQ9H3Y6 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRMSQ9H3Y6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRMSQ9H3Y6 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRMSQ9H3Y6 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SRMSQ9H3Y6 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRMSQ9H3Y6 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRMSQ9H3Y6 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SRMSQ9H3Y6 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SRMSQ9H3Y6 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRMSQ9H3Y6 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRMSQ9H3Y6 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRMSQ9H3Y6 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRMSQ9H3Y6 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRMSQ9H3Y6 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SRMSQ9H3Y6 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRMSQ9H3Y6 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRMSQ9H3Y6 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRMSQ9H3Y6 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRMSQ9H3Y6 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRMSQ9H3Y6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRMSQ9H3Y6 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRMSQ9H3Y6 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRMSQ9H3Y6 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRMSQ9H3Y6 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRMSQ9H3Y6 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRMSQ9H3Y6 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRMSQ9H3Y6 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRMSQ9H3Y6 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRMSQ9H3Y6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SRMSQ9H3Y6 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SRMSQ9H3Y6 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SRMSQ9H3Y6 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SRMSQ9H3Y6 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SRMSQ9H3Y6 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SRMSQ9H3Y6 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRMSQ9H3Y6 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRMSQ9H3Y6 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRMSQ9H3Y6 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRMSQ9H3Y6 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRMSQ9H3Y6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRMSQ9H3Y6 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRMSQ9H3Y6 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SRMSQ9H3Y6 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SRMSQ9H3Y6 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SRMSQ9H3Y6 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SRMSQ9H3Y6 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SRMSQ9H3Y6 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SRMSQ9H3Y6 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
SRMSQ9H3Y6 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SRMSQ9H3Y6 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SRMSQ9H3Y6 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRMSQ9H3Y6 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRMSQ9H3Y6 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRMSQ9H3Y6 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRMSQ9H3Y6 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRMSQ9H3Y6 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRMSQ9H3Y6 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRMSQ9H3Y6 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SRMSQ9H3Y6 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SRMSQ9H3Y6 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SRMSQ9H3Y6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SRMSQ9H3Y6 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SRMSQ9H3Y6 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SRMSQ9H3Y6 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SRMSQ9H3Y6 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SRMSQ9H3Y6 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SRMSQ9H3Y6 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SRMSQ9H3Y6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SRMSQ9H3Y6 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SRMSQ9H3Y6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SRMSQ9H3Y6 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SRMSQ9H3Y6 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SRMSQ9H3Y6 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SRMSQ9H3Y6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SRMSQ9H3Y6 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SRMSQ9H3Y6 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms