Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2L5

RASSF4, Ras association domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASSF4Q9H2L5 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RASSF4Q9H2L5 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RASSF4Q9H2L5 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RASSF4Q9H2L5 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RASSF4Q9H2L5 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RASSF4Q9H2L5 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RASSF4Q9H2L5 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RASSF4Q9H2L5 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RASSF4Q9H2L5 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RASSF4Q9H2L5 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RASSF4Q9H2L5 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RASSF4Q9H2L5 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RASSF4Q9H2L5 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RASSF4Q9H2L5 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RASSF4Q9H2L5 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RASSF4Q9H2L5 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RASSF4Q9H2L5 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RASSF4Q9H2L5 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RASSF4Q9H2L5 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RASSF4Q9H2L5 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RASSF4Q9H2L5 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RASSF4Q9H2L5 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RASSF4Q9H2L5 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RASSF4Q9H2L5 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RASSF4Q9H2L5 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RASSF4Q9H2L5 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RASSF4Q9H2L5 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RASSF4Q9H2L5 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RASSF4Q9H2L5 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RASSF4Q9H2L5 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RASSF4Q9H2L5 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RASSF4Q9H2L5 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RASSF4Q9H2L5 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RASSF4Q9H2L5 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RASSF4Q9H2L5 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RASSF4Q9H2L5 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RASSF4Q9H2L5 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RASSF4Q9H2L5 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RASSF4Q9H2L5 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RASSF4Q9H2L5 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RASSF4Q9H2L5 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RASSF4Q9H2L5 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RASSF4Q9H2L5 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RASSF4Q9H2L5 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RASSF4Q9H2L5 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RASSF4Q9H2L5 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RASSF4Q9H2L5 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RASSF4Q9H2L5 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RASSF4Q9H2L5 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RASSF4Q9H2L5 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RASSF4Q9H2L5 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RASSF4Q9H2L5 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RASSF4Q9H2L5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RASSF4Q9H2L5 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RASSF4Q9H2L5 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RASSF4Q9H2L5 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RASSF4Q9H2L5 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RASSF4Q9H2L5 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RASSF4Q9H2L5 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RASSF4Q9H2L5 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RASSF4Q9H2L5 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RASSF4Q9H2L5 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RASSF4Q9H2L5 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RASSF4Q9H2L5 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RASSF4Q9H2L5 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RASSF4Q9H2L5 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RASSF4Q9H2L5 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RASSF4Q9H2L5 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RASSF4Q9H2L5 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RASSF4Q9H2L5 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RASSF4Q9H2L5 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RASSF4Q9H2L5 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RASSF4Q9H2L5 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RASSF4Q9H2L5 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RASSF4Q9H2L5 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RASSF4Q9H2L5 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RASSF4Q9H2L5 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RASSF4Q9H2L5 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RASSF4Q9H2L5 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RASSF4Q9H2L5 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RASSF4Q9H2L5 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RASSF4Q9H2L5 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RASSF4Q9H2L5 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RASSF4Q9H2L5 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RASSF4Q9H2L5 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RASSF4Q9H2L5 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RASSF4Q9H2L5 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RASSF4Q9H2L5 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RASSF4Q9H2L5 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RASSF4Q9H2L5 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RASSF4Q9H2L5 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RASSF4Q9H2L5 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RASSF4Q9H2L5 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RASSF4Q9H2L5 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RASSF4Q9H2L5 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RASSF4Q9H2L5 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RASSF4Q9H2L5 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RASSF4Q9H2L5 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RASSF4Q9H2L5 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RASSF4Q9H2L5 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms