Protein–RNA interactions for Protein: Q9H173

SIL1, Nucleotide exchange factor SIL1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIL1Q9H173 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SIL1Q9H173 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
SIL1Q9H173 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SIL1Q9H173 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SIL1Q9H173 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SIL1Q9H173 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SIL1Q9H173 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SIL1Q9H173 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SIL1Q9H173 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SIL1Q9H173 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SIL1Q9H173 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SIL1Q9H173 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SIL1Q9H173 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SIL1Q9H173 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SIL1Q9H173 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SIL1Q9H173 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SIL1Q9H173 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SIL1Q9H173 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SIL1Q9H173 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SIL1Q9H173 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SIL1Q9H173 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SIL1Q9H173 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
SIL1Q9H173 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SIL1Q9H173 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SIL1Q9H173 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
SIL1Q9H173 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
SIL1Q9H173 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SIL1Q9H173 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SIL1Q9H173 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SIL1Q9H173 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SIL1Q9H173 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SIL1Q9H173 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SIL1Q9H173 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SIL1Q9H173 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SIL1Q9H173 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SIL1Q9H173 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SIL1Q9H173 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SIL1Q9H173 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SIL1Q9H173 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SIL1Q9H173 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SIL1Q9H173 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SIL1Q9H173 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SIL1Q9H173 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SIL1Q9H173 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SIL1Q9H173 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SIL1Q9H173 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SIL1Q9H173 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SIL1Q9H173 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SIL1Q9H173 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SIL1Q9H173 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SIL1Q9H173 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SIL1Q9H173 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SIL1Q9H173 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SIL1Q9H173 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SIL1Q9H173 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SIL1Q9H173 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
SIL1Q9H173 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SIL1Q9H173 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
SIL1Q9H173 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SIL1Q9H173 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SIL1Q9H173 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SIL1Q9H173 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SIL1Q9H173 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SIL1Q9H173 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SIL1Q9H173 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SIL1Q9H173 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SIL1Q9H173 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SIL1Q9H173 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SIL1Q9H173 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SIL1Q9H173 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SIL1Q9H173 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SIL1Q9H173 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
SIL1Q9H173 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SIL1Q9H173 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SIL1Q9H173 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
SIL1Q9H173 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SIL1Q9H173 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SIL1Q9H173 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SIL1Q9H173 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SIL1Q9H173 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SIL1Q9H173 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SIL1Q9H173 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SIL1Q9H173 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SIL1Q9H173 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SIL1Q9H173 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SIL1Q9H173 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SIL1Q9H173 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SIL1Q9H173 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SIL1Q9H173 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SIL1Q9H173 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SIL1Q9H173 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SIL1Q9H173 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SIL1Q9H173 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SIL1Q9H173 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SIL1Q9H173 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SIL1Q9H173 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SIL1Q9H173 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SIL1Q9H173 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SIL1Q9H173 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SIL1Q9H173 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms