Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B1

FTO, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase FTO, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FTOQ9C0B1 HNF1A-205ENST00000538626 582 ntTSL 1 (best)19.85■□□□□ 0.771e-6■■■□□ 14.8
FTOQ9C0B1 FCGRT-218ENST00000600273 582 ntTSL 219.79■□□□□ 0.761e-6■■■□□ 14.8
FTOQ9C0B1 FCGRT-209ENST00000596147 383 ntTSL 319.66■□□□□ 0.741e-6■■■□□ 14.8
FTOQ9C0B1 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.721e-6■■■□□ 14.8
FTOQ9C0B1 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.631e-6■■■□□ 14.8
FTOQ9C0B1 HNF1A-203ENST00000402929 3002 ntTSL 218.84■□□□□ 0.611e-6■■■□□ 14.8
FTOQ9C0B1 PLCB1-214ENST00000626161 706 ntTSL 518.62■□□□□ 0.571e-6■■■□□ 14.8
FTOQ9C0B1 HNF1A-214ENST00000560968 3030 ntTSL 1 (best)18.58■□□□□ 0.571e-6■■■□□ 14.8
FTOQ9C0B1 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.541e-6■■■□□ 14.8
FTOQ9C0B1 FCGRT-216ENST00000599701 579 ntTSL 217.86■□□□□ 0.451e-6■■■□□ 14.8
FTOQ9C0B1 FCGRT-206ENST00000594823 819 ntTSL 517.55■□□□□ 0.41e-6■■■□□ 14.8
FTOQ9C0B1 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.331e-6■■■□□ 14.8
FTOQ9C0B1 FCGRT-207ENST00000595677 714 ntTSL 516.87■□□□□ 0.291e-6■■■□□ 14.8
FTOQ9C0B1 FCGRT-213ENST00000598491 578 ntTSL 516.71■□□□□ 0.271e-6■■■□□ 14.8
FTOQ9C0B1 HNF1A-201ENST00000257555 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.151e-6■■■□□ 14.8
FTOQ9C0B1 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.141e-6■■■□□ 14.8
FTOQ9C0B1 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.091e-6■■■□□ 14.8
FTOQ9C0B1 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.091e-6■■■□□ 14.8
FTOQ9C0B1 GTF2I-203ENST00000443166 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.111e-6■■■□□ 14.8
FTOQ9C0B1 GTF2I-218ENST00000620879 4352 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.191e-6■■■□□ 14.8
FTOQ9C0B1 PANK3-201ENST00000239231 10506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.271e-6■■■□□ 14.8
FTOQ9C0B1 HNF1A-204ENST00000535955 434 ntTSL 1 (best)12.95□□□□□ -0.341e-6■■■□□ 14.8
FTOQ9C0B1 AL137230.2-201ENST00000555070 452 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.781e-6■■■□□ 14.8
FTOQ9C0B1 PLCB1-219ENST00000630495 759 ntTSL 59.51□□□□□ -0.891e-6■■■□□ 14.8
FTOQ9C0B1 FOXN3-208ENST00000555034 505 ntTSL 38.94□□□□□ -0.981e-6■■■□□ 14.8
FTOQ9C0B1 SSRP1-205ENST00000635721 675 ntTSL 58.64□□□□□ -1.037e-8■■■□□ 14.8
FTOQ9C0B1 FOXN3-205ENST00000553904 337 ntTSL 37.53□□□□□ -1.21e-6■■■□□ 14.8
FTOQ9C0B1 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.911e-6■■■□□ 14.8
FTOQ9C0B1 TAB2-208ENST00000636456 3092 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.041e-6■■■□□ 14.8
FTOQ9C0B1 TAB2-206ENST00000606202 648 ntTSL 44.08□□□□□ -1.761e-6■■■□□ 14.8
FTOQ9C0B1 SLC6A8-203ENST00000429147 334 ntTSL 218.96■□□□□ 0.634e-10■■■□□ 14.8
FTOQ9C0B1 SLC6A8-208ENST00000467402 308 ntTSL 513.84□□□□□ -0.194e-10■■■□□ 14.8
FTOQ9C0B1 CDC37-202ENST00000588498 690 ntTSL 320.03■□□□□ 0.83e-7■■■□□ 14.8
FTOQ9C0B1 SLC4A2-218ENST00000494125 782 ntTSL 227.82■■■□□ 2.042e-6■■■□□ 14.8
FTOQ9C0B1 SLC4A2-213ENST00000483786 571 ntTSL 419.57■□□□□ 0.722e-6■■■□□ 14.8
FTOQ9C0B1 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.452e-6■■■□□ 14.8
FTOQ9C0B1 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.432e-6■■■□□ 14.8
FTOQ9C0B1 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.161e-6■■■□□ 14.8
FTOQ9C0B1 B4GALT2-207ENST00000497866 980 ntTSL 232.7■■■□□ 2.831e-6■■■□□ 14.8
FTOQ9C0B1 B4GALT2-208ENST00000498543 360 ntTSL 320.26■□□□□ 0.831e-6■■■□□ 14.8
FTOQ9C0B1 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.65e-6■■■□□ 14.7
FTOQ9C0B1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.45e-6■■■□□ 14.7
FTOQ9C0B1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.245e-6■■■□□ 14.7
FTOQ9C0B1 BCL7C-204ENST00000574418 1206 ntTSL 529.02■■■□□ 2.245e-6■■■□□ 14.7
FTOQ9C0B1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.195e-6■■■□□ 14.7
FTOQ9C0B1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.157e-11■■■□□ 14.7
FTOQ9C0B1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.145e-6■■■□□ 14.7
FTOQ9C0B1 HSDL1-206ENST00000567294 542 ntTSL 228.4■■■□□ 2.145e-6■■■□□ 14.7
FTOQ9C0B1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.135e-6■■■□□ 14.7
FTOQ9C0B1 CHTF8-209ENST00000522497 831 ntTSL 227.79■■■□□ 2.045e-6■■■□□ 14.7
FTOQ9C0B1 CHTF8-211ENST00000567763 734 ntTSL 227.71■■■□□ 2.035e-6■■■□□ 14.7
FTOQ9C0B1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.025e-6■■■□□ 14.7
FTOQ9C0B1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 27e-11■■■□□ 14.7
FTOQ9C0B1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.986e-7■■■□□ 14.7
FTOQ9C0B1 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.895e-6■■■□□ 14.7
FTOQ9C0B1 ORAI2-206ENST00000482237 463 ntTSL 426.8■■□□□ 1.885e-6■■■□□ 14.7
FTOQ9C0B1 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.845e-6■■■□□ 14.7
FTOQ9C0B1 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.765e-6■■■□□ 14.7
FTOQ9C0B1 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.735e-6■■■□□ 14.7
FTOQ9C0B1 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.735e-6■■■□□ 14.7
FTOQ9C0B1 RAD51-204ENST00000525066 1545 ntTSL 525.71■■□□□ 1.717e-11■■■□□ 14.7
FTOQ9C0B1 TTBK2-203ENST00000564431 743 ntTSL 325.2■■□□□ 1.625e-6■■■□□ 14.7
FTOQ9C0B1 ORAI2-208ENST00000495936 937 ntTSL 225.11■■□□□ 1.615e-6■■■□□ 14.7
FTOQ9C0B1 UBE2G1-203ENST00000571980 984 ntTSL 524.84■■□□□ 1.575e-6■■■□□ 14.7
FTOQ9C0B1 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.525e-6■■■□□ 14.7
FTOQ9C0B1 HSDL1-204ENST00000564998 459 ntTSL 424.21■■□□□ 1.475e-6■■■□□ 14.7
FTOQ9C0B1 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.465e-6■■■□□ 14.7
FTOQ9C0B1 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.425e-6■■■□□ 14.7
FTOQ9C0B1 UBE2G1-206ENST00000574633 863 ntTSL 223.29■■□□□ 1.325e-6■■■□□ 14.7
FTOQ9C0B1 TTBK2-204ENST00000566931 520 ntTSL 523.03■■□□□ 1.285e-6■■■□□ 14.7
FTOQ9C0B1 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.275e-6■■■□□ 14.7
FTOQ9C0B1 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.225e-6■■■□□ 14.7
FTOQ9C0B1 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.195e-6■■■□□ 14.7
FTOQ9C0B1 SLC35B1-209ENST00000507773 1320 ntTSL 522.5■■□□□ 1.195e-6■■■□□ 14.7
FTOQ9C0B1 ORAI2-203ENST00000468241 736 ntTSL 222.46■■□□□ 1.195e-6■■■□□ 14.7
FTOQ9C0B1 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.175e-6■■■□□ 14.7
FTOQ9C0B1 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.116e-7■■■□□ 14.7
FTOQ9C0B1 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.115e-6■■■□□ 14.7
FTOQ9C0B1 SLC35B1-214ENST00000509781 806 ntTSL 221.05■□□□□ 0.965e-6■■■□□ 14.7
FTOQ9C0B1 SLC35B1-219ENST00000515850 862 ntTSL 521.02■□□□□ 0.965e-6■■■□□ 14.7
FTOQ9C0B1 SLC35B1-202ENST00000435059 910 ntTSL 221.02■□□□□ 0.965e-6■■■□□ 14.7
FTOQ9C0B1 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.935e-6■■■□□ 14.7
FTOQ9C0B1 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.925e-6■■■□□ 14.7
FTOQ9C0B1 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.95e-6■■■□□ 14.7
FTOQ9C0B1 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.885e-6■■■□□ 14.7
FTOQ9C0B1 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.867e-11■■■□□ 14.7
FTOQ9C0B1 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.812e-25■■■□□ 14.7
FTOQ9C0B1 SLC35B1-216ENST00000511763 581 ntTSL 320.09■□□□□ 0.815e-6■■■□□ 14.7
FTOQ9C0B1 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.795e-6■■■□□ 14.7
FTOQ9C0B1 LEPR-206ENST00000462765 2117 ntTSL 1 (best)19.95■□□□□ 0.785e-6■■■□□ 14.7
FTOQ9C0B1 TRAPPC3-207ENST00000497251 715 ntTSL 219.64■□□□□ 0.735e-6■■■□□ 14.7
FTOQ9C0B1 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.675e-6■■■□□ 14.7
FTOQ9C0B1 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.675e-6■■■□□ 14.7
FTOQ9C0B1 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.655e-6■■■□□ 14.7
FTOQ9C0B1 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.65e-6■■■□□ 14.7
FTOQ9C0B1 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.582e-25■■■□□ 14.7
FTOQ9C0B1 HSDL1-203ENST00000562224 457 ntTSL 418.66■□□□□ 0.585e-6■■■□□ 14.7
FTOQ9C0B1 LUC7L3-217ENST00000510984 505 ntTSL 318.55■□□□□ 0.565e-6■■■□□ 14.7
FTOQ9C0B1 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.535e-6■■■□□ 14.7
FTOQ9C0B1 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.525e-6■■■□□ 14.7
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