Protein–RNA interactions for Protein: Q9C019

TRIM15, Tripartite motif-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM15Q9C019 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM15Q9C019 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM15Q9C019 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM15Q9C019 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM15Q9C019 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM15Q9C019 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM15Q9C019 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM15Q9C019 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM15Q9C019 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM15Q9C019 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM15Q9C019 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM15Q9C019 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM15Q9C019 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM15Q9C019 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM15Q9C019 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM15Q9C019 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM15Q9C019 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM15Q9C019 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM15Q9C019 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM15Q9C019 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM15Q9C019 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM15Q9C019 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM15Q9C019 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM15Q9C019 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM15Q9C019 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM15Q9C019 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM15Q9C019 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM15Q9C019 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM15Q9C019 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM15Q9C019 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM15Q9C019 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM15Q9C019 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM15Q9C019 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM15Q9C019 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM15Q9C019 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM15Q9C019 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRIM15Q9C019 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRIM15Q9C019 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRIM15Q9C019 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRIM15Q9C019 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRIM15Q9C019 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM15Q9C019 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM15Q9C019 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM15Q9C019 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM15Q9C019 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM15Q9C019 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM15Q9C019 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM15Q9C019 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM15Q9C019 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM15Q9C019 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM15Q9C019 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM15Q9C019 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM15Q9C019 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM15Q9C019 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM15Q9C019 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM15Q9C019 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM15Q9C019 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM15Q9C019 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM15Q9C019 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM15Q9C019 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM15Q9C019 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM15Q9C019 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM15Q9C019 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM15Q9C019 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM15Q9C019 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM15Q9C019 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM15Q9C019 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM15Q9C019 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM15Q9C019 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM15Q9C019 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM15Q9C019 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM15Q9C019 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM15Q9C019 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM15Q9C019 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM15Q9C019 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM15Q9C019 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM15Q9C019 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM15Q9C019 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM15Q9C019 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM15Q9C019 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM15Q9C019 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM15Q9C019 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM15Q9C019 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM15Q9C019 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM15Q9C019 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM15Q9C019 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM15Q9C019 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM15Q9C019 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM15Q9C019 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM15Q9C019 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM15Q9C019 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM15Q9C019 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM15Q9C019 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM15Q9C019 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM15Q9C019 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM15Q9C019 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM15Q9C019 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM15Q9C019 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM15Q9C019 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM15Q9C019 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.4 ms