Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZS1

FOXP3, Forkhead box protein P3, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXP3Q9BZS1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
FOXP3Q9BZS1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FOXP3Q9BZS1 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOXP3Q9BZS1 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOXP3Q9BZS1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOXP3Q9BZS1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOXP3Q9BZS1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOXP3Q9BZS1 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOXP3Q9BZS1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOXP3Q9BZS1 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOXP3Q9BZS1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOXP3Q9BZS1 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOXP3Q9BZS1 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FOXP3Q9BZS1 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FOXP3Q9BZS1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FOXP3Q9BZS1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FOXP3Q9BZS1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FOXP3Q9BZS1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FOXP3Q9BZS1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
FOXP3Q9BZS1 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FOXP3Q9BZS1 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FOXP3Q9BZS1 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
FOXP3Q9BZS1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FOXP3Q9BZS1 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
FOXP3Q9BZS1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FOXP3Q9BZS1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FOXP3Q9BZS1 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FOXP3Q9BZS1 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FOXP3Q9BZS1 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FOXP3Q9BZS1 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FOXP3Q9BZS1 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FOXP3Q9BZS1 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
FOXP3Q9BZS1 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOXP3Q9BZS1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOXP3Q9BZS1 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOXP3Q9BZS1 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOXP3Q9BZS1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOXP3Q9BZS1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
FOXP3Q9BZS1 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOXP3Q9BZS1 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXP3Q9BZS1 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXP3Q9BZS1 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXP3Q9BZS1 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXP3Q9BZS1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXP3Q9BZS1 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXP3Q9BZS1 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXP3Q9BZS1 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXP3Q9BZS1 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXP3Q9BZS1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXP3Q9BZS1 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXP3Q9BZS1 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOXP3Q9BZS1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOXP3Q9BZS1 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOXP3Q9BZS1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOXP3Q9BZS1 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOXP3Q9BZS1 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOXP3Q9BZS1 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOXP3Q9BZS1 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOXP3Q9BZS1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOXP3Q9BZS1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOXP3Q9BZS1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOXP3Q9BZS1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
FOXP3Q9BZS1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
FOXP3Q9BZS1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOXP3Q9BZS1 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOXP3Q9BZS1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOXP3Q9BZS1 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOXP3Q9BZS1 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOXP3Q9BZS1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOXP3Q9BZS1 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOXP3Q9BZS1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOXP3Q9BZS1 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOXP3Q9BZS1 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOXP3Q9BZS1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOXP3Q9BZS1 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOXP3Q9BZS1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
FOXP3Q9BZS1 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOXP3Q9BZS1 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOXP3Q9BZS1 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOXP3Q9BZS1 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOXP3Q9BZS1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOXP3Q9BZS1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOXP3Q9BZS1 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOXP3Q9BZS1 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
FOXP3Q9BZS1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FOXP3Q9BZS1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FOXP3Q9BZS1 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FOXP3Q9BZS1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FOXP3Q9BZS1 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FOXP3Q9BZS1 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FOXP3Q9BZS1 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FOXP3Q9BZS1 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FOXP3Q9BZS1 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FOXP3Q9BZS1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FOXP3Q9BZS1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOXP3Q9BZS1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOXP3Q9BZS1 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOXP3Q9BZS1 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOXP3Q9BZS1 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOXP3Q9BZS1 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms