Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE3

BARHL1, BarH-like 1 homeobox protein, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BARHL1Q9BZE3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BARHL1Q9BZE3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BARHL1Q9BZE3 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BARHL1Q9BZE3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BARHL1Q9BZE3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BARHL1Q9BZE3 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BARHL1Q9BZE3 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BARHL1Q9BZE3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BARHL1Q9BZE3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BARHL1Q9BZE3 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BARHL1Q9BZE3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BARHL1Q9BZE3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BARHL1Q9BZE3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BARHL1Q9BZE3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BARHL1Q9BZE3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BARHL1Q9BZE3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
BARHL1Q9BZE3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BARHL1Q9BZE3 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BARHL1Q9BZE3 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BARHL1Q9BZE3 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BARHL1Q9BZE3 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BARHL1Q9BZE3 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BARHL1Q9BZE3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BARHL1Q9BZE3 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BARHL1Q9BZE3 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BARHL1Q9BZE3 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BARHL1Q9BZE3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BARHL1Q9BZE3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BARHL1Q9BZE3 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BARHL1Q9BZE3 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BARHL1Q9BZE3 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BARHL1Q9BZE3 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BARHL1Q9BZE3 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BARHL1Q9BZE3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BARHL1Q9BZE3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BARHL1Q9BZE3 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BARHL1Q9BZE3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BARHL1Q9BZE3 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BARHL1Q9BZE3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BARHL1Q9BZE3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BARHL1Q9BZE3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BARHL1Q9BZE3 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BARHL1Q9BZE3 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BARHL1Q9BZE3 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BARHL1Q9BZE3 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BARHL1Q9BZE3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BARHL1Q9BZE3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BARHL1Q9BZE3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BARHL1Q9BZE3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
BARHL1Q9BZE3 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BARHL1Q9BZE3 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
BARHL1Q9BZE3 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BARHL1Q9BZE3 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BARHL1Q9BZE3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BARHL1Q9BZE3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BARHL1Q9BZE3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
BARHL1Q9BZE3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BARHL1Q9BZE3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
BARHL1Q9BZE3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BARHL1Q9BZE3 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BARHL1Q9BZE3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BARHL1Q9BZE3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BARHL1Q9BZE3 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BARHL1Q9BZE3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BARHL1Q9BZE3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BARHL1Q9BZE3 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BARHL1Q9BZE3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BARHL1Q9BZE3 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BARHL1Q9BZE3 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BARHL1Q9BZE3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BARHL1Q9BZE3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BARHL1Q9BZE3 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BARHL1Q9BZE3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BARHL1Q9BZE3 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BARHL1Q9BZE3 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
BARHL1Q9BZE3 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BARHL1Q9BZE3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
BARHL1Q9BZE3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BARHL1Q9BZE3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BARHL1Q9BZE3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BARHL1Q9BZE3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BARHL1Q9BZE3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BARHL1Q9BZE3 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BARHL1Q9BZE3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BARHL1Q9BZE3 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BARHL1Q9BZE3 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BARHL1Q9BZE3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BARHL1Q9BZE3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BARHL1Q9BZE3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BARHL1Q9BZE3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
BARHL1Q9BZE3 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BARHL1Q9BZE3 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BARHL1Q9BZE3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BARHL1Q9BZE3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BARHL1Q9BZE3 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BARHL1Q9BZE3 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BARHL1Q9BZE3 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BARHL1Q9BZE3 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BARHL1Q9BZE3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
BARHL1Q9BZE3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms