Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZB8

CPEB1, Cytoplasmic polyadenylation element-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPEB1Q9BZB8 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CPEB1Q9BZB8 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CPEB1Q9BZB8 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CPEB1Q9BZB8 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CPEB1Q9BZB8 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CPEB1Q9BZB8 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CPEB1Q9BZB8 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CPEB1Q9BZB8 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CPEB1Q9BZB8 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CPEB1Q9BZB8 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CPEB1Q9BZB8 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CPEB1Q9BZB8 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CPEB1Q9BZB8 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CPEB1Q9BZB8 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CPEB1Q9BZB8 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CPEB1Q9BZB8 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CPEB1Q9BZB8 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CPEB1Q9BZB8 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CPEB1Q9BZB8 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CPEB1Q9BZB8 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CPEB1Q9BZB8 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CPEB1Q9BZB8 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CPEB1Q9BZB8 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CPEB1Q9BZB8 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CPEB1Q9BZB8 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CPEB1Q9BZB8 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CPEB1Q9BZB8 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CPEB1Q9BZB8 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CPEB1Q9BZB8 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CPEB1Q9BZB8 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CPEB1Q9BZB8 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CPEB1Q9BZB8 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CPEB1Q9BZB8 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CPEB1Q9BZB8 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CPEB1Q9BZB8 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CPEB1Q9BZB8 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CPEB1Q9BZB8 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CPEB1Q9BZB8 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CPEB1Q9BZB8 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CPEB1Q9BZB8 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CPEB1Q9BZB8 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CPEB1Q9BZB8 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CPEB1Q9BZB8 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CPEB1Q9BZB8 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CPEB1Q9BZB8 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CPEB1Q9BZB8 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CPEB1Q9BZB8 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CPEB1Q9BZB8 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CPEB1Q9BZB8 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CPEB1Q9BZB8 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CPEB1Q9BZB8 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CPEB1Q9BZB8 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CPEB1Q9BZB8 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CPEB1Q9BZB8 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CPEB1Q9BZB8 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CPEB1Q9BZB8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CPEB1Q9BZB8 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CPEB1Q9BZB8 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CPEB1Q9BZB8 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CPEB1Q9BZB8 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CPEB1Q9BZB8 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CPEB1Q9BZB8 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CPEB1Q9BZB8 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CPEB1Q9BZB8 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CPEB1Q9BZB8 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CPEB1Q9BZB8 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CPEB1Q9BZB8 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CPEB1Q9BZB8 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CPEB1Q9BZB8 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CPEB1Q9BZB8 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CPEB1Q9BZB8 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CPEB1Q9BZB8 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CPEB1Q9BZB8 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CPEB1Q9BZB8 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CPEB1Q9BZB8 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CPEB1Q9BZB8 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CPEB1Q9BZB8 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CPEB1Q9BZB8 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CPEB1Q9BZB8 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CPEB1Q9BZB8 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CPEB1Q9BZB8 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CPEB1Q9BZB8 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CPEB1Q9BZB8 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CPEB1Q9BZB8 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CPEB1Q9BZB8 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CPEB1Q9BZB8 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CPEB1Q9BZB8 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CPEB1Q9BZB8 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CPEB1Q9BZB8 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CPEB1Q9BZB8 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CPEB1Q9BZB8 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CPEB1Q9BZB8 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CPEB1Q9BZB8 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CPEB1Q9BZB8 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CPEB1Q9BZB8 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CPEB1Q9BZB8 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CPEB1Q9BZB8 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CPEB1Q9BZB8 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CPEB1Q9BZB8 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CPEB1Q9BZB8 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms