Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYX4

IFIH1, Interferon-induced helicase C domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFIH1Q9BYX4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
IFIH1Q9BYX4 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
IFIH1Q9BYX4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
IFIH1Q9BYX4 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
IFIH1Q9BYX4 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
IFIH1Q9BYX4 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
IFIH1Q9BYX4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
IFIH1Q9BYX4 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
IFIH1Q9BYX4 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
IFIH1Q9BYX4 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
IFIH1Q9BYX4 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
IFIH1Q9BYX4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
IFIH1Q9BYX4 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
IFIH1Q9BYX4 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
IFIH1Q9BYX4 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
IFIH1Q9BYX4 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
IFIH1Q9BYX4 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
IFIH1Q9BYX4 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
IFIH1Q9BYX4 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
IFIH1Q9BYX4 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
IFIH1Q9BYX4 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
IFIH1Q9BYX4 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
IFIH1Q9BYX4 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
IFIH1Q9BYX4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
IFIH1Q9BYX4 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
IFIH1Q9BYX4 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
IFIH1Q9BYX4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
IFIH1Q9BYX4 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
IFIH1Q9BYX4 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
IFIH1Q9BYX4 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
IFIH1Q9BYX4 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
IFIH1Q9BYX4 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
IFIH1Q9BYX4 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
IFIH1Q9BYX4 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
IFIH1Q9BYX4 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
IFIH1Q9BYX4 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
IFIH1Q9BYX4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
IFIH1Q9BYX4 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
IFIH1Q9BYX4 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
IFIH1Q9BYX4 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
IFIH1Q9BYX4 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
IFIH1Q9BYX4 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
IFIH1Q9BYX4 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
IFIH1Q9BYX4 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
IFIH1Q9BYX4 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
IFIH1Q9BYX4 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
IFIH1Q9BYX4 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
IFIH1Q9BYX4 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
IFIH1Q9BYX4 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
IFIH1Q9BYX4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
IFIH1Q9BYX4 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
IFIH1Q9BYX4 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
IFIH1Q9BYX4 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
IFIH1Q9BYX4 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
IFIH1Q9BYX4 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
IFIH1Q9BYX4 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
IFIH1Q9BYX4 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
IFIH1Q9BYX4 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
IFIH1Q9BYX4 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
IFIH1Q9BYX4 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
IFIH1Q9BYX4 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
IFIH1Q9BYX4 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
IFIH1Q9BYX4 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
IFIH1Q9BYX4 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
IFIH1Q9BYX4 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
IFIH1Q9BYX4 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
IFIH1Q9BYX4 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
IFIH1Q9BYX4 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
IFIH1Q9BYX4 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
IFIH1Q9BYX4 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
IFIH1Q9BYX4 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
IFIH1Q9BYX4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
IFIH1Q9BYX4 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
IFIH1Q9BYX4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
IFIH1Q9BYX4 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
IFIH1Q9BYX4 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
IFIH1Q9BYX4 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
IFIH1Q9BYX4 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
IFIH1Q9BYX4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
IFIH1Q9BYX4 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
IFIH1Q9BYX4 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
IFIH1Q9BYX4 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
IFIH1Q9BYX4 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
IFIH1Q9BYX4 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
IFIH1Q9BYX4 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
IFIH1Q9BYX4 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
IFIH1Q9BYX4 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
IFIH1Q9BYX4 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
IFIH1Q9BYX4 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
IFIH1Q9BYX4 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
IFIH1Q9BYX4 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
IFIH1Q9BYX4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
IFIH1Q9BYX4 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
IFIH1Q9BYX4 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
IFIH1Q9BYX4 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
IFIH1Q9BYX4 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
IFIH1Q9BYX4 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
IFIH1Q9BYX4 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
IFIH1Q9BYX4 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
IFIH1Q9BYX4 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms