Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW72

HIGD2A, HIG1 domain family member 2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD2AQ9BW72 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
HIGD2AQ9BW72 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HIGD2AQ9BW72 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HIGD2AQ9BW72 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HIGD2AQ9BW72 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HIGD2AQ9BW72 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HIGD2AQ9BW72 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HIGD2AQ9BW72 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
HIGD2AQ9BW72 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
HIGD2AQ9BW72 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HIGD2AQ9BW72 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
HIGD2AQ9BW72 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
HIGD2AQ9BW72 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
HIGD2AQ9BW72 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
HIGD2AQ9BW72 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HIGD2AQ9BW72 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
HIGD2AQ9BW72 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
HIGD2AQ9BW72 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
HIGD2AQ9BW72 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
HIGD2AQ9BW72 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
HIGD2AQ9BW72 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
HIGD2AQ9BW72 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
HIGD2AQ9BW72 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
HIGD2AQ9BW72 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
HIGD2AQ9BW72 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
HIGD2AQ9BW72 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
HIGD2AQ9BW72 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
HIGD2AQ9BW72 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
HIGD2AQ9BW72 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
HIGD2AQ9BW72 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
HIGD2AQ9BW72 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
HIGD2AQ9BW72 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
HIGD2AQ9BW72 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
HIGD2AQ9BW72 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
HIGD2AQ9BW72 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
HIGD2AQ9BW72 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
HIGD2AQ9BW72 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
HIGD2AQ9BW72 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
HIGD2AQ9BW72 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
HIGD2AQ9BW72 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
HIGD2AQ9BW72 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
HIGD2AQ9BW72 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
HIGD2AQ9BW72 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
HIGD2AQ9BW72 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
HIGD2AQ9BW72 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
HIGD2AQ9BW72 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HIGD2AQ9BW72 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
HIGD2AQ9BW72 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HIGD2AQ9BW72 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
HIGD2AQ9BW72 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HIGD2AQ9BW72 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HIGD2AQ9BW72 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HIGD2AQ9BW72 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
HIGD2AQ9BW72 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
HIGD2AQ9BW72 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
HIGD2AQ9BW72 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HIGD2AQ9BW72 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HIGD2AQ9BW72 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HIGD2AQ9BW72 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
HIGD2AQ9BW72 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
HIGD2AQ9BW72 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HIGD2AQ9BW72 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HIGD2AQ9BW72 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HIGD2AQ9BW72 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HIGD2AQ9BW72 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
HIGD2AQ9BW72 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HIGD2AQ9BW72 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HIGD2AQ9BW72 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HIGD2AQ9BW72 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HIGD2AQ9BW72 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HIGD2AQ9BW72 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HIGD2AQ9BW72 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
HIGD2AQ9BW72 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HIGD2AQ9BW72 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
HIGD2AQ9BW72 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
HIGD2AQ9BW72 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
HIGD2AQ9BW72 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
HIGD2AQ9BW72 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
HIGD2AQ9BW72 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
HIGD2AQ9BW72 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
HIGD2AQ9BW72 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
HIGD2AQ9BW72 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
HIGD2AQ9BW72 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
HIGD2AQ9BW72 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
HIGD2AQ9BW72 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
HIGD2AQ9BW72 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
HIGD2AQ9BW72 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
HIGD2AQ9BW72 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
HIGD2AQ9BW72 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
HIGD2AQ9BW72 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
HIGD2AQ9BW72 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
HIGD2AQ9BW72 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
HIGD2AQ9BW72 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
HIGD2AQ9BW72 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
HIGD2AQ9BW72 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.12
HIGD2AQ9BW72 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
HIGD2AQ9BW72 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
HIGD2AQ9BW72 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
HIGD2AQ9BW72 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
HIGD2AQ9BW72 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms