Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV19

C1orf50, Uncharacterized protein C1orf50, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf50Q9BV19 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C1orf50Q9BV19 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C1orf50Q9BV19 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C1orf50Q9BV19 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C1orf50Q9BV19 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C1orf50Q9BV19 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C1orf50Q9BV19 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C1orf50Q9BV19 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C1orf50Q9BV19 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C1orf50Q9BV19 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C1orf50Q9BV19 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C1orf50Q9BV19 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C1orf50Q9BV19 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C1orf50Q9BV19 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C1orf50Q9BV19 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C1orf50Q9BV19 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C1orf50Q9BV19 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C1orf50Q9BV19 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C1orf50Q9BV19 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C1orf50Q9BV19 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
C1orf50Q9BV19 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C1orf50Q9BV19 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
C1orf50Q9BV19 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C1orf50Q9BV19 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
C1orf50Q9BV19 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C1orf50Q9BV19 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C1orf50Q9BV19 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C1orf50Q9BV19 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
C1orf50Q9BV19 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C1orf50Q9BV19 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C1orf50Q9BV19 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C1orf50Q9BV19 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C1orf50Q9BV19 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C1orf50Q9BV19 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C1orf50Q9BV19 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C1orf50Q9BV19 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C1orf50Q9BV19 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C1orf50Q9BV19 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C1orf50Q9BV19 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C1orf50Q9BV19 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C1orf50Q9BV19 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C1orf50Q9BV19 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C1orf50Q9BV19 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C1orf50Q9BV19 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C1orf50Q9BV19 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C1orf50Q9BV19 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C1orf50Q9BV19 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C1orf50Q9BV19 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
C1orf50Q9BV19 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
C1orf50Q9BV19 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C1orf50Q9BV19 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C1orf50Q9BV19 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
C1orf50Q9BV19 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C1orf50Q9BV19 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
C1orf50Q9BV19 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
C1orf50Q9BV19 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
C1orf50Q9BV19 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
C1orf50Q9BV19 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C1orf50Q9BV19 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C1orf50Q9BV19 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C1orf50Q9BV19 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C1orf50Q9BV19 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C1orf50Q9BV19 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
C1orf50Q9BV19 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C1orf50Q9BV19 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
C1orf50Q9BV19 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C1orf50Q9BV19 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C1orf50Q9BV19 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
C1orf50Q9BV19 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C1orf50Q9BV19 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C1orf50Q9BV19 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C1orf50Q9BV19 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C1orf50Q9BV19 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C1orf50Q9BV19 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
C1orf50Q9BV19 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C1orf50Q9BV19 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C1orf50Q9BV19 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
C1orf50Q9BV19 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
C1orf50Q9BV19 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
C1orf50Q9BV19 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C1orf50Q9BV19 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
C1orf50Q9BV19 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
C1orf50Q9BV19 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
C1orf50Q9BV19 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
C1orf50Q9BV19 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
C1orf50Q9BV19 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
C1orf50Q9BV19 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
C1orf50Q9BV19 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
C1orf50Q9BV19 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
C1orf50Q9BV19 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
C1orf50Q9BV19 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
C1orf50Q9BV19 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
C1orf50Q9BV19 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
C1orf50Q9BV19 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C1orf50Q9BV19 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
C1orf50Q9BV19 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C1orf50Q9BV19 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C1orf50Q9BV19 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C1orf50Q9BV19 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
C1orf50Q9BV19 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms