Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTN0

LRFN3, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRFN3Q9BTN0 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRFN3Q9BTN0 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRFN3Q9BTN0 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRFN3Q9BTN0 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRFN3Q9BTN0 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRFN3Q9BTN0 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRFN3Q9BTN0 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRFN3Q9BTN0 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRFN3Q9BTN0 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRFN3Q9BTN0 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRFN3Q9BTN0 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRFN3Q9BTN0 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRFN3Q9BTN0 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRFN3Q9BTN0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRFN3Q9BTN0 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRFN3Q9BTN0 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRFN3Q9BTN0 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
LRFN3Q9BTN0 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRFN3Q9BTN0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRFN3Q9BTN0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRFN3Q9BTN0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRFN3Q9BTN0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRFN3Q9BTN0 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRFN3Q9BTN0 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRFN3Q9BTN0 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRFN3Q9BTN0 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRFN3Q9BTN0 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRFN3Q9BTN0 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRFN3Q9BTN0 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRFN3Q9BTN0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRFN3Q9BTN0 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRFN3Q9BTN0 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRFN3Q9BTN0 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRFN3Q9BTN0 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRFN3Q9BTN0 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRFN3Q9BTN0 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRFN3Q9BTN0 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRFN3Q9BTN0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRFN3Q9BTN0 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRFN3Q9BTN0 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRFN3Q9BTN0 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRFN3Q9BTN0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRFN3Q9BTN0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRFN3Q9BTN0 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRFN3Q9BTN0 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRFN3Q9BTN0 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRFN3Q9BTN0 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRFN3Q9BTN0 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRFN3Q9BTN0 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRFN3Q9BTN0 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRFN3Q9BTN0 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRFN3Q9BTN0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRFN3Q9BTN0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRFN3Q9BTN0 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
LRFN3Q9BTN0 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRFN3Q9BTN0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRFN3Q9BTN0 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRFN3Q9BTN0 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRFN3Q9BTN0 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRFN3Q9BTN0 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRFN3Q9BTN0 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRFN3Q9BTN0 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRFN3Q9BTN0 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRFN3Q9BTN0 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRFN3Q9BTN0 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRFN3Q9BTN0 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRFN3Q9BTN0 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRFN3Q9BTN0 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRFN3Q9BTN0 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRFN3Q9BTN0 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRFN3Q9BTN0 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRFN3Q9BTN0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRFN3Q9BTN0 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRFN3Q9BTN0 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRFN3Q9BTN0 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRFN3Q9BTN0 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRFN3Q9BTN0 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRFN3Q9BTN0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRFN3Q9BTN0 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRFN3Q9BTN0 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRFN3Q9BTN0 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRFN3Q9BTN0 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRFN3Q9BTN0 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRFN3Q9BTN0 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRFN3Q9BTN0 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
LRFN3Q9BTN0 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRFN3Q9BTN0 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRFN3Q9BTN0 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRFN3Q9BTN0 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRFN3Q9BTN0 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRFN3Q9BTN0 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRFN3Q9BTN0 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRFN3Q9BTN0 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRFN3Q9BTN0 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
LRFN3Q9BTN0 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
LRFN3Q9BTN0 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRFN3Q9BTN0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRFN3Q9BTN0 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
LRFN3Q9BTN0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRFN3Q9BTN0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms