Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD1

SHANK2-AS3, Putative uncharacterized protein SHANK2-AS3, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2-AS3Q9BTD1 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SHANK2-AS3Q9BTD1 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SHANK2-AS3Q9BTD1 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SHANK2-AS3Q9BTD1 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SHANK2-AS3Q9BTD1 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SHANK2-AS3Q9BTD1 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SHANK2-AS3Q9BTD1 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SHANK2-AS3Q9BTD1 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SHANK2-AS3Q9BTD1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SHANK2-AS3Q9BTD1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SHANK2-AS3Q9BTD1 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SHANK2-AS3Q9BTD1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SHANK2-AS3Q9BTD1 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SHANK2-AS3Q9BTD1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SHANK2-AS3Q9BTD1 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SHANK2-AS3Q9BTD1 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SHANK2-AS3Q9BTD1 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SHANK2-AS3Q9BTD1 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SHANK2-AS3Q9BTD1 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SHANK2-AS3Q9BTD1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SHANK2-AS3Q9BTD1 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SHANK2-AS3Q9BTD1 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SHANK2-AS3Q9BTD1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SHANK2-AS3Q9BTD1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SHANK2-AS3Q9BTD1 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SHANK2-AS3Q9BTD1 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SHANK2-AS3Q9BTD1 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SHANK2-AS3Q9BTD1 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SHANK2-AS3Q9BTD1 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SHANK2-AS3Q9BTD1 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SHANK2-AS3Q9BTD1 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SHANK2-AS3Q9BTD1 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SHANK2-AS3Q9BTD1 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SHANK2-AS3Q9BTD1 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SHANK2-AS3Q9BTD1 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SHANK2-AS3Q9BTD1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SHANK2-AS3Q9BTD1 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SHANK2-AS3Q9BTD1 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SHANK2-AS3Q9BTD1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SHANK2-AS3Q9BTD1 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SHANK2-AS3Q9BTD1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SHANK2-AS3Q9BTD1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SHANK2-AS3Q9BTD1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SHANK2-AS3Q9BTD1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SHANK2-AS3Q9BTD1 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SHANK2-AS3Q9BTD1 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SHANK2-AS3Q9BTD1 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SHANK2-AS3Q9BTD1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SHANK2-AS3Q9BTD1 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SHANK2-AS3Q9BTD1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SHANK2-AS3Q9BTD1 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SHANK2-AS3Q9BTD1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SHANK2-AS3Q9BTD1 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SHANK2-AS3Q9BTD1 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SHANK2-AS3Q9BTD1 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SHANK2-AS3Q9BTD1 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SHANK2-AS3Q9BTD1 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SHANK2-AS3Q9BTD1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SHANK2-AS3Q9BTD1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SHANK2-AS3Q9BTD1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SHANK2-AS3Q9BTD1 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SHANK2-AS3Q9BTD1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SHANK2-AS3Q9BTD1 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SHANK2-AS3Q9BTD1 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SHANK2-AS3Q9BTD1 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SHANK2-AS3Q9BTD1 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SHANK2-AS3Q9BTD1 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SHANK2-AS3Q9BTD1 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SHANK2-AS3Q9BTD1 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SHANK2-AS3Q9BTD1 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SHANK2-AS3Q9BTD1 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SHANK2-AS3Q9BTD1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SHANK2-AS3Q9BTD1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SHANK2-AS3Q9BTD1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SHANK2-AS3Q9BTD1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SHANK2-AS3Q9BTD1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SHANK2-AS3Q9BTD1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SHANK2-AS3Q9BTD1 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SHANK2-AS3Q9BTD1 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
SHANK2-AS3Q9BTD1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SHANK2-AS3Q9BTD1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SHANK2-AS3Q9BTD1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SHANK2-AS3Q9BTD1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SHANK2-AS3Q9BTD1 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SHANK2-AS3Q9BTD1 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SHANK2-AS3Q9BTD1 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SHANK2-AS3Q9BTD1 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SHANK2-AS3Q9BTD1 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SHANK2-AS3Q9BTD1 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms