Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRV8

SIKE1, Suppressor of IKBKE 1, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIKE1Q9BRV8 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SIKE1Q9BRV8 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SIKE1Q9BRV8 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SIKE1Q9BRV8 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SIKE1Q9BRV8 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SIKE1Q9BRV8 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SIKE1Q9BRV8 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SIKE1Q9BRV8 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SIKE1Q9BRV8 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SIKE1Q9BRV8 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SIKE1Q9BRV8 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SIKE1Q9BRV8 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SIKE1Q9BRV8 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SIKE1Q9BRV8 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SIKE1Q9BRV8 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SIKE1Q9BRV8 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SIKE1Q9BRV8 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SIKE1Q9BRV8 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SIKE1Q9BRV8 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SIKE1Q9BRV8 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SIKE1Q9BRV8 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SIKE1Q9BRV8 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SIKE1Q9BRV8 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SIKE1Q9BRV8 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SIKE1Q9BRV8 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SIKE1Q9BRV8 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SIKE1Q9BRV8 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SIKE1Q9BRV8 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SIKE1Q9BRV8 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SIKE1Q9BRV8 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SIKE1Q9BRV8 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SIKE1Q9BRV8 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SIKE1Q9BRV8 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SIKE1Q9BRV8 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SIKE1Q9BRV8 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SIKE1Q9BRV8 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SIKE1Q9BRV8 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SIKE1Q9BRV8 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SIKE1Q9BRV8 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SIKE1Q9BRV8 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SIKE1Q9BRV8 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SIKE1Q9BRV8 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SIKE1Q9BRV8 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SIKE1Q9BRV8 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SIKE1Q9BRV8 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SIKE1Q9BRV8 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SIKE1Q9BRV8 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SIKE1Q9BRV8 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SIKE1Q9BRV8 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SIKE1Q9BRV8 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SIKE1Q9BRV8 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SIKE1Q9BRV8 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SIKE1Q9BRV8 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SIKE1Q9BRV8 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SIKE1Q9BRV8 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SIKE1Q9BRV8 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SIKE1Q9BRV8 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SIKE1Q9BRV8 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SIKE1Q9BRV8 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SIKE1Q9BRV8 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SIKE1Q9BRV8 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIKE1Q9BRV8 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIKE1Q9BRV8 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIKE1Q9BRV8 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIKE1Q9BRV8 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIKE1Q9BRV8 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIKE1Q9BRV8 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIKE1Q9BRV8 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIKE1Q9BRV8 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIKE1Q9BRV8 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIKE1Q9BRV8 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIKE1Q9BRV8 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIKE1Q9BRV8 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SIKE1Q9BRV8 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SIKE1Q9BRV8 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIKE1Q9BRV8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIKE1Q9BRV8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIKE1Q9BRV8 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIKE1Q9BRV8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIKE1Q9BRV8 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SIKE1Q9BRV8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIKE1Q9BRV8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIKE1Q9BRV8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIKE1Q9BRV8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIKE1Q9BRV8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIKE1Q9BRV8 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIKE1Q9BRV8 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIKE1Q9BRV8 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIKE1Q9BRV8 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIKE1Q9BRV8 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIKE1Q9BRV8 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIKE1Q9BRV8 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIKE1Q9BRV8 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIKE1Q9BRV8 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SIKE1Q9BRV8 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIKE1Q9BRV8 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIKE1Q9BRV8 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIKE1Q9BRV8 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIKE1Q9BRV8 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIKE1Q9BRV8 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms