Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRR3

TMEM246, Transmembrane protein 246, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM246Q9BRR3 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM246Q9BRR3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM246Q9BRR3 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM246Q9BRR3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM246Q9BRR3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM246Q9BRR3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM246Q9BRR3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM246Q9BRR3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM246Q9BRR3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM246Q9BRR3 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM246Q9BRR3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM246Q9BRR3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM246Q9BRR3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM246Q9BRR3 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM246Q9BRR3 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM246Q9BRR3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM246Q9BRR3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM246Q9BRR3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM246Q9BRR3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM246Q9BRR3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM246Q9BRR3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM246Q9BRR3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM246Q9BRR3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM246Q9BRR3 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM246Q9BRR3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM246Q9BRR3 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM246Q9BRR3 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM246Q9BRR3 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM246Q9BRR3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM246Q9BRR3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM246Q9BRR3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM246Q9BRR3 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM246Q9BRR3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM246Q9BRR3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM246Q9BRR3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM246Q9BRR3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM246Q9BRR3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TMEM246Q9BRR3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TMEM246Q9BRR3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TMEM246Q9BRR3 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM246Q9BRR3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM246Q9BRR3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM246Q9BRR3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM246Q9BRR3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM246Q9BRR3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM246Q9BRR3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM246Q9BRR3 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM246Q9BRR3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM246Q9BRR3 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM246Q9BRR3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM246Q9BRR3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM246Q9BRR3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM246Q9BRR3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM246Q9BRR3 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM246Q9BRR3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM246Q9BRR3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM246Q9BRR3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM246Q9BRR3 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM246Q9BRR3 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM246Q9BRR3 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM246Q9BRR3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM246Q9BRR3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM246Q9BRR3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM246Q9BRR3 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM246Q9BRR3 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM246Q9BRR3 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM246Q9BRR3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM246Q9BRR3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM246Q9BRR3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM246Q9BRR3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM246Q9BRR3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM246Q9BRR3 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM246Q9BRR3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM246Q9BRR3 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM246Q9BRR3 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM246Q9BRR3 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM246Q9BRR3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM246Q9BRR3 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM246Q9BRR3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM246Q9BRR3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM246Q9BRR3 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM246Q9BRR3 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM246Q9BRR3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM246Q9BRR3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM246Q9BRR3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM246Q9BRR3 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM246Q9BRR3 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM246Q9BRR3 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM246Q9BRR3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM246Q9BRR3 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM246Q9BRR3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM246Q9BRR3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM246Q9BRR3 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM246Q9BRR3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM246Q9BRR3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM246Q9BRR3 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM246Q9BRR3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM246Q9BRR3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM246Q9BRR3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM246Q9BRR3 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms