Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRA2

TXNDC17, Thioredoxin domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC17Q9BRA2 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TXNDC17Q9BRA2 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TXNDC17Q9BRA2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TXNDC17Q9BRA2 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TXNDC17Q9BRA2 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TXNDC17Q9BRA2 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TXNDC17Q9BRA2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TXNDC17Q9BRA2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TXNDC17Q9BRA2 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TXNDC17Q9BRA2 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
TXNDC17Q9BRA2 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TXNDC17Q9BRA2 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TXNDC17Q9BRA2 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TXNDC17Q9BRA2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TXNDC17Q9BRA2 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TXNDC17Q9BRA2 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TXNDC17Q9BRA2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TXNDC17Q9BRA2 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TXNDC17Q9BRA2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TXNDC17Q9BRA2 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TXNDC17Q9BRA2 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TXNDC17Q9BRA2 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TXNDC17Q9BRA2 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TXNDC17Q9BRA2 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TXNDC17Q9BRA2 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TXNDC17Q9BRA2 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TXNDC17Q9BRA2 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TXNDC17Q9BRA2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TXNDC17Q9BRA2 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TXNDC17Q9BRA2 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
TXNDC17Q9BRA2 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TXNDC17Q9BRA2 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TXNDC17Q9BRA2 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
TXNDC17Q9BRA2 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
TXNDC17Q9BRA2 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
TXNDC17Q9BRA2 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
TXNDC17Q9BRA2 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
TXNDC17Q9BRA2 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
TXNDC17Q9BRA2 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
TXNDC17Q9BRA2 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
TXNDC17Q9BRA2 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
TXNDC17Q9BRA2 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
TXNDC17Q9BRA2 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
TXNDC17Q9BRA2 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
TXNDC17Q9BRA2 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TXNDC17Q9BRA2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TXNDC17Q9BRA2 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TXNDC17Q9BRA2 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TXNDC17Q9BRA2 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TXNDC17Q9BRA2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TXNDC17Q9BRA2 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TXNDC17Q9BRA2 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TXNDC17Q9BRA2 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TXNDC17Q9BRA2 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TXNDC17Q9BRA2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TXNDC17Q9BRA2 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TXNDC17Q9BRA2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TXNDC17Q9BRA2 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TXNDC17Q9BRA2 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TXNDC17Q9BRA2 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TXNDC17Q9BRA2 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TXNDC17Q9BRA2 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TXNDC17Q9BRA2 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TXNDC17Q9BRA2 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TXNDC17Q9BRA2 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TXNDC17Q9BRA2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TXNDC17Q9BRA2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TXNDC17Q9BRA2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TXNDC17Q9BRA2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TXNDC17Q9BRA2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TXNDC17Q9BRA2 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TXNDC17Q9BRA2 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TXNDC17Q9BRA2 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TXNDC17Q9BRA2 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TXNDC17Q9BRA2 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TXNDC17Q9BRA2 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TXNDC17Q9BRA2 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TXNDC17Q9BRA2 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TXNDC17Q9BRA2 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TXNDC17Q9BRA2 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TXNDC17Q9BRA2 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TXNDC17Q9BRA2 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TXNDC17Q9BRA2 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TXNDC17Q9BRA2 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TXNDC17Q9BRA2 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TXNDC17Q9BRA2 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TXNDC17Q9BRA2 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TXNDC17Q9BRA2 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TXNDC17Q9BRA2 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TXNDC17Q9BRA2 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TXNDC17Q9BRA2 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TXNDC17Q9BRA2 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TXNDC17Q9BRA2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TXNDC17Q9BRA2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TXNDC17Q9BRA2 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TXNDC17Q9BRA2 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TXNDC17Q9BRA2 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TXNDC17Q9BRA2 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TXNDC17Q9BRA2 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TXNDC17Q9BRA2 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms