Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR77

CCDC77, Coiled-coil domain-containing protein 77, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC77Q9BR77 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC77Q9BR77 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC77Q9BR77 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC77Q9BR77 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC77Q9BR77 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC77Q9BR77 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC77Q9BR77 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC77Q9BR77 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC77Q9BR77 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC77Q9BR77 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC77Q9BR77 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC77Q9BR77 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC77Q9BR77 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC77Q9BR77 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC77Q9BR77 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC77Q9BR77 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC77Q9BR77 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC77Q9BR77 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC77Q9BR77 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC77Q9BR77 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC77Q9BR77 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC77Q9BR77 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC77Q9BR77 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC77Q9BR77 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC77Q9BR77 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC77Q9BR77 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC77Q9BR77 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC77Q9BR77 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC77Q9BR77 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC77Q9BR77 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC77Q9BR77 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC77Q9BR77 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC77Q9BR77 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC77Q9BR77 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC77Q9BR77 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC77Q9BR77 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC77Q9BR77 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC77Q9BR77 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC77Q9BR77 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC77Q9BR77 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC77Q9BR77 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC77Q9BR77 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC77Q9BR77 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC77Q9BR77 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC77Q9BR77 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC77Q9BR77 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC77Q9BR77 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC77Q9BR77 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC77Q9BR77 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC77Q9BR77 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC77Q9BR77 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC77Q9BR77 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC77Q9BR77 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC77Q9BR77 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC77Q9BR77 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC77Q9BR77 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC77Q9BR77 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC77Q9BR77 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC77Q9BR77 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC77Q9BR77 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC77Q9BR77 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC77Q9BR77 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC77Q9BR77 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC77Q9BR77 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC77Q9BR77 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC77Q9BR77 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC77Q9BR77 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC77Q9BR77 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC77Q9BR77 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC77Q9BR77 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC77Q9BR77 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC77Q9BR77 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC77Q9BR77 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC77Q9BR77 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC77Q9BR77 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC77Q9BR77 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC77Q9BR77 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC77Q9BR77 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC77Q9BR77 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC77Q9BR77 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC77Q9BR77 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC77Q9BR77 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC77Q9BR77 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC77Q9BR77 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC77Q9BR77 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC77Q9BR77 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC77Q9BR77 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC77Q9BR77 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC77Q9BR77 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC77Q9BR77 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC77Q9BR77 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC77Q9BR77 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC77Q9BR77 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC77Q9BR77 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC77Q9BR77 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC77Q9BR77 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC77Q9BR77 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC77Q9BR77 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC77Q9BR77 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC77Q9BR77 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms