Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ04

RBM4B, RNA-binding protein 4B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM4BQ9BQ04 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RBM4BQ9BQ04 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RBM4BQ9BQ04 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RBM4BQ9BQ04 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RBM4BQ9BQ04 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RBM4BQ9BQ04 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RBM4BQ9BQ04 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RBM4BQ9BQ04 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RBM4BQ9BQ04 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RBM4BQ9BQ04 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RBM4BQ9BQ04 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
RBM4BQ9BQ04 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RBM4BQ9BQ04 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RBM4BQ9BQ04 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RBM4BQ9BQ04 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
RBM4BQ9BQ04 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RBM4BQ9BQ04 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RBM4BQ9BQ04 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RBM4BQ9BQ04 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RBM4BQ9BQ04 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RBM4BQ9BQ04 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RBM4BQ9BQ04 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RBM4BQ9BQ04 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RBM4BQ9BQ04 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RBM4BQ9BQ04 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RBM4BQ9BQ04 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RBM4BQ9BQ04 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
RBM4BQ9BQ04 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RBM4BQ9BQ04 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RBM4BQ9BQ04 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RBM4BQ9BQ04 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RBM4BQ9BQ04 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RBM4BQ9BQ04 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RBM4BQ9BQ04 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RBM4BQ9BQ04 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RBM4BQ9BQ04 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RBM4BQ9BQ04 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RBM4BQ9BQ04 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RBM4BQ9BQ04 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RBM4BQ9BQ04 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RBM4BQ9BQ04 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RBM4BQ9BQ04 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RBM4BQ9BQ04 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RBM4BQ9BQ04 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RBM4BQ9BQ04 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RBM4BQ9BQ04 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RBM4BQ9BQ04 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RBM4BQ9BQ04 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
RBM4BQ9BQ04 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
RBM4BQ9BQ04 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RBM4BQ9BQ04 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RBM4BQ9BQ04 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RBM4BQ9BQ04 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RBM4BQ9BQ04 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RBM4BQ9BQ04 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RBM4BQ9BQ04 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RBM4BQ9BQ04 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RBM4BQ9BQ04 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RBM4BQ9BQ04 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RBM4BQ9BQ04 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RBM4BQ9BQ04 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RBM4BQ9BQ04 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RBM4BQ9BQ04 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RBM4BQ9BQ04 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RBM4BQ9BQ04 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RBM4BQ9BQ04 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RBM4BQ9BQ04 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RBM4BQ9BQ04 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RBM4BQ9BQ04 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RBM4BQ9BQ04 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RBM4BQ9BQ04 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RBM4BQ9BQ04 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RBM4BQ9BQ04 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RBM4BQ9BQ04 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RBM4BQ9BQ04 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RBM4BQ9BQ04 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RBM4BQ9BQ04 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RBM4BQ9BQ04 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
RBM4BQ9BQ04 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
RBM4BQ9BQ04 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
RBM4BQ9BQ04 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
RBM4BQ9BQ04 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RBM4BQ9BQ04 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RBM4BQ9BQ04 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RBM4BQ9BQ04 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RBM4BQ9BQ04 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
RBM4BQ9BQ04 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RBM4BQ9BQ04 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RBM4BQ9BQ04 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RBM4BQ9BQ04 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
RBM4BQ9BQ04 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
RBM4BQ9BQ04 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RBM4BQ9BQ04 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RBM4BQ9BQ04 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21■□□□□ 0.95
RBM4BQ9BQ04 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RBM4BQ9BQ04 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
RBM4BQ9BQ04 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
RBM4BQ9BQ04 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21■□□□□ 0.95
RBM4BQ9BQ04 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RBM4BQ9BQ04 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms