Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW8

NIPSNAP1, Protein NipSnap homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP1Q9BPW8 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
NIPSNAP1Q9BPW8 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NIPSNAP1Q9BPW8 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NIPSNAP1Q9BPW8 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NIPSNAP1Q9BPW8 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NIPSNAP1Q9BPW8 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NIPSNAP1Q9BPW8 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NIPSNAP1Q9BPW8 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NIPSNAP1Q9BPW8 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NIPSNAP1Q9BPW8 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NIPSNAP1Q9BPW8 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NIPSNAP1Q9BPW8 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NIPSNAP1Q9BPW8 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NIPSNAP1Q9BPW8 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NIPSNAP1Q9BPW8 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NIPSNAP1Q9BPW8 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NIPSNAP1Q9BPW8 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NIPSNAP1Q9BPW8 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
NIPSNAP1Q9BPW8 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NIPSNAP1Q9BPW8 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NIPSNAP1Q9BPW8 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NIPSNAP1Q9BPW8 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NIPSNAP1Q9BPW8 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NIPSNAP1Q9BPW8 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NIPSNAP1Q9BPW8 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NIPSNAP1Q9BPW8 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NIPSNAP1Q9BPW8 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
NIPSNAP1Q9BPW8 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
NIPSNAP1Q9BPW8 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
NIPSNAP1Q9BPW8 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NIPSNAP1Q9BPW8 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NIPSNAP1Q9BPW8 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NIPSNAP1Q9BPW8 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NIPSNAP1Q9BPW8 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NIPSNAP1Q9BPW8 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NIPSNAP1Q9BPW8 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NIPSNAP1Q9BPW8 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NIPSNAP1Q9BPW8 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NIPSNAP1Q9BPW8 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NIPSNAP1Q9BPW8 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NIPSNAP1Q9BPW8 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NIPSNAP1Q9BPW8 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NIPSNAP1Q9BPW8 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NIPSNAP1Q9BPW8 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NIPSNAP1Q9BPW8 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NIPSNAP1Q9BPW8 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NIPSNAP1Q9BPW8 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NIPSNAP1Q9BPW8 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NIPSNAP1Q9BPW8 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NIPSNAP1Q9BPW8 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NIPSNAP1Q9BPW8 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
NIPSNAP1Q9BPW8 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NIPSNAP1Q9BPW8 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NIPSNAP1Q9BPW8 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NIPSNAP1Q9BPW8 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NIPSNAP1Q9BPW8 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NIPSNAP1Q9BPW8 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NIPSNAP1Q9BPW8 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NIPSNAP1Q9BPW8 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NIPSNAP1Q9BPW8 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NIPSNAP1Q9BPW8 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NIPSNAP1Q9BPW8 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NIPSNAP1Q9BPW8 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NIPSNAP1Q9BPW8 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NIPSNAP1Q9BPW8 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NIPSNAP1Q9BPW8 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NIPSNAP1Q9BPW8 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NIPSNAP1Q9BPW8 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NIPSNAP1Q9BPW8 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NIPSNAP1Q9BPW8 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NIPSNAP1Q9BPW8 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NIPSNAP1Q9BPW8 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NIPSNAP1Q9BPW8 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NIPSNAP1Q9BPW8 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NIPSNAP1Q9BPW8 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NIPSNAP1Q9BPW8 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NIPSNAP1Q9BPW8 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NIPSNAP1Q9BPW8 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NIPSNAP1Q9BPW8 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NIPSNAP1Q9BPW8 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NIPSNAP1Q9BPW8 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NIPSNAP1Q9BPW8 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NIPSNAP1Q9BPW8 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
NIPSNAP1Q9BPW8 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
NIPSNAP1Q9BPW8 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NIPSNAP1Q9BPW8 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
NIPSNAP1Q9BPW8 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NIPSNAP1Q9BPW8 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NIPSNAP1Q9BPW8 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NIPSNAP1Q9BPW8 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NIPSNAP1Q9BPW8 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NIPSNAP1Q9BPW8 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NIPSNAP1Q9BPW8 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NIPSNAP1Q9BPW8 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NIPSNAP1Q9BPW8 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NIPSNAP1Q9BPW8 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NIPSNAP1Q9BPW8 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NIPSNAP1Q9BPW8 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NIPSNAP1Q9BPW8 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms