Protein–RNA interactions for Protein: Q99653

CHP1, Calcineurin B homologous protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHP1Q99653 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHP1Q99653 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHP1Q99653 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHP1Q99653 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHP1Q99653 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHP1Q99653 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHP1Q99653 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHP1Q99653 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHP1Q99653 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHP1Q99653 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHP1Q99653 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHP1Q99653 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHP1Q99653 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHP1Q99653 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CHP1Q99653 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CHP1Q99653 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHP1Q99653 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHP1Q99653 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHP1Q99653 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHP1Q99653 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHP1Q99653 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHP1Q99653 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CHP1Q99653 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHP1Q99653 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHP1Q99653 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHP1Q99653 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHP1Q99653 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHP1Q99653 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHP1Q99653 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHP1Q99653 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHP1Q99653 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHP1Q99653 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHP1Q99653 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHP1Q99653 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHP1Q99653 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHP1Q99653 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHP1Q99653 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHP1Q99653 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHP1Q99653 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHP1Q99653 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHP1Q99653 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHP1Q99653 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHP1Q99653 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHP1Q99653 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHP1Q99653 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CHP1Q99653 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHP1Q99653 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHP1Q99653 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHP1Q99653 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHP1Q99653 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHP1Q99653 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHP1Q99653 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHP1Q99653 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHP1Q99653 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHP1Q99653 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHP1Q99653 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHP1Q99653 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHP1Q99653 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHP1Q99653 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHP1Q99653 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CHP1Q99653 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHP1Q99653 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHP1Q99653 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHP1Q99653 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHP1Q99653 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHP1Q99653 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHP1Q99653 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CHP1Q99653 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHP1Q99653 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHP1Q99653 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHP1Q99653 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHP1Q99653 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHP1Q99653 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CHP1Q99653 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHP1Q99653 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHP1Q99653 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHP1Q99653 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHP1Q99653 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHP1Q99653 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHP1Q99653 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHP1Q99653 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHP1Q99653 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHP1Q99653 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHP1Q99653 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHP1Q99653 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHP1Q99653 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHP1Q99653 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHP1Q99653 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHP1Q99653 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHP1Q99653 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHP1Q99653 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHP1Q99653 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHP1Q99653 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHP1Q99653 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHP1Q99653 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHP1Q99653 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHP1Q99653 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHP1Q99653 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHP1Q99653 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CHP1Q99653 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms