Protein–RNA interactions for Protein: Q96QE5

TEFM, Transcription elongation factor, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TEFMQ96QE5 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TEFMQ96QE5 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TEFMQ96QE5 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TEFMQ96QE5 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TEFMQ96QE5 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TEFMQ96QE5 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TEFMQ96QE5 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TEFMQ96QE5 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TEFMQ96QE5 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TEFMQ96QE5 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TEFMQ96QE5 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TEFMQ96QE5 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TEFMQ96QE5 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TEFMQ96QE5 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TEFMQ96QE5 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TEFMQ96QE5 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TEFMQ96QE5 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TEFMQ96QE5 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TEFMQ96QE5 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TEFMQ96QE5 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TEFMQ96QE5 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TEFMQ96QE5 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TEFMQ96QE5 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TEFMQ96QE5 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TEFMQ96QE5 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TEFMQ96QE5 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TEFMQ96QE5 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TEFMQ96QE5 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TEFMQ96QE5 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TEFMQ96QE5 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TEFMQ96QE5 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TEFMQ96QE5 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TEFMQ96QE5 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TEFMQ96QE5 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TEFMQ96QE5 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TEFMQ96QE5 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TEFMQ96QE5 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TEFMQ96QE5 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TEFMQ96QE5 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TEFMQ96QE5 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TEFMQ96QE5 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TEFMQ96QE5 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TEFMQ96QE5 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TEFMQ96QE5 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TEFMQ96QE5 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TEFMQ96QE5 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TEFMQ96QE5 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TEFMQ96QE5 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TEFMQ96QE5 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TEFMQ96QE5 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TEFMQ96QE5 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TEFMQ96QE5 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TEFMQ96QE5 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TEFMQ96QE5 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TEFMQ96QE5 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TEFMQ96QE5 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TEFMQ96QE5 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TEFMQ96QE5 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TEFMQ96QE5 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TEFMQ96QE5 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TEFMQ96QE5 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TEFMQ96QE5 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TEFMQ96QE5 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TEFMQ96QE5 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TEFMQ96QE5 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TEFMQ96QE5 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TEFMQ96QE5 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TEFMQ96QE5 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TEFMQ96QE5 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TEFMQ96QE5 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TEFMQ96QE5 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TEFMQ96QE5 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TEFMQ96QE5 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TEFMQ96QE5 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TEFMQ96QE5 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TEFMQ96QE5 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TEFMQ96QE5 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TEFMQ96QE5 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TEFMQ96QE5 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TEFMQ96QE5 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TEFMQ96QE5 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TEFMQ96QE5 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TEFMQ96QE5 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TEFMQ96QE5 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TEFMQ96QE5 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TEFMQ96QE5 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TEFMQ96QE5 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TEFMQ96QE5 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TEFMQ96QE5 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TEFMQ96QE5 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TEFMQ96QE5 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TEFMQ96QE5 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TEFMQ96QE5 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TEFMQ96QE5 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TEFMQ96QE5 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TEFMQ96QE5 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TEFMQ96QE5 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TEFMQ96QE5 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TEFMQ96QE5 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TEFMQ96QE5 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms