Protein–RNA interactions for Protein: Q96NL6

SCLT1, Sodium channel and clathrin linker 1, humanhuman

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCLT1Q96NL6 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCLT1Q96NL6 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCLT1Q96NL6 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SCLT1Q96NL6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCLT1Q96NL6 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCLT1Q96NL6 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCLT1Q96NL6 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCLT1Q96NL6 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCLT1Q96NL6 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCLT1Q96NL6 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SCLT1Q96NL6 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCLT1Q96NL6 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SCLT1Q96NL6 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCLT1Q96NL6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCLT1Q96NL6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCLT1Q96NL6 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCLT1Q96NL6 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCLT1Q96NL6 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCLT1Q96NL6 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCLT1Q96NL6 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCLT1Q96NL6 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCLT1Q96NL6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCLT1Q96NL6 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCLT1Q96NL6 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCLT1Q96NL6 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCLT1Q96NL6 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCLT1Q96NL6 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCLT1Q96NL6 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCLT1Q96NL6 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCLT1Q96NL6 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCLT1Q96NL6 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCLT1Q96NL6 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCLT1Q96NL6 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCLT1Q96NL6 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCLT1Q96NL6 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCLT1Q96NL6 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCLT1Q96NL6 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCLT1Q96NL6 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCLT1Q96NL6 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCLT1Q96NL6 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCLT1Q96NL6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCLT1Q96NL6 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCLT1Q96NL6 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCLT1Q96NL6 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCLT1Q96NL6 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCLT1Q96NL6 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCLT1Q96NL6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCLT1Q96NL6 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCLT1Q96NL6 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCLT1Q96NL6 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCLT1Q96NL6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCLT1Q96NL6 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCLT1Q96NL6 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCLT1Q96NL6 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCLT1Q96NL6 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCLT1Q96NL6 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCLT1Q96NL6 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCLT1Q96NL6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCLT1Q96NL6 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCLT1Q96NL6 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCLT1Q96NL6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCLT1Q96NL6 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCLT1Q96NL6 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCLT1Q96NL6 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCLT1Q96NL6 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCLT1Q96NL6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCLT1Q96NL6 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCLT1Q96NL6 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCLT1Q96NL6 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCLT1Q96NL6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCLT1Q96NL6 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCLT1Q96NL6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCLT1Q96NL6 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SCLT1Q96NL6 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SCLT1Q96NL6 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SCLT1Q96NL6 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCLT1Q96NL6 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCLT1Q96NL6 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCLT1Q96NL6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCLT1Q96NL6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCLT1Q96NL6 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCLT1Q96NL6 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCLT1Q96NL6 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCLT1Q96NL6 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCLT1Q96NL6 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCLT1Q96NL6 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCLT1Q96NL6 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCLT1Q96NL6 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCLT1Q96NL6 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCLT1Q96NL6 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCLT1Q96NL6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCLT1Q96NL6 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCLT1Q96NL6 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCLT1Q96NL6 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SCLT1Q96NL6 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCLT1Q96NL6 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCLT1Q96NL6 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SCLT1Q96NL6 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCLT1Q96NL6 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCLT1Q96NL6 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms