Protein–RNA interactions for Protein: Q96M60

FAM227B, Protein FAM227B, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM227BQ96M60 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
FAM227BQ96M60 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FAM227BQ96M60 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FAM227BQ96M60 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
FAM227BQ96M60 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.52■■■□□ 2
FAM227BQ96M60 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
FAM227BQ96M60 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
FAM227BQ96M60 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
FAM227BQ96M60 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FAM227BQ96M60 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FAM227BQ96M60 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FAM227BQ96M60 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
FAM227BQ96M60 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FAM227BQ96M60 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
FAM227BQ96M60 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
FAM227BQ96M60 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
FAM227BQ96M60 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FAM227BQ96M60 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
FAM227BQ96M60 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
FAM227BQ96M60 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
FAM227BQ96M60 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FAM227BQ96M60 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FAM227BQ96M60 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
FAM227BQ96M60 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FAM227BQ96M60 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
FAM227BQ96M60 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
FAM227BQ96M60 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
FAM227BQ96M60 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
FAM227BQ96M60 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
FAM227BQ96M60 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
FAM227BQ96M60 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
FAM227BQ96M60 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
FAM227BQ96M60 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
FAM227BQ96M60 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
FAM227BQ96M60 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
FAM227BQ96M60 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
FAM227BQ96M60 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
FAM227BQ96M60 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
FAM227BQ96M60 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
FAM227BQ96M60 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
FAM227BQ96M60 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
FAM227BQ96M60 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
FAM227BQ96M60 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
FAM227BQ96M60 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
FAM227BQ96M60 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
FAM227BQ96M60 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
FAM227BQ96M60 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
FAM227BQ96M60 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
FAM227BQ96M60 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
FAM227BQ96M60 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
FAM227BQ96M60 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
FAM227BQ96M60 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
FAM227BQ96M60 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
FAM227BQ96M60 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
FAM227BQ96M60 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
FAM227BQ96M60 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
FAM227BQ96M60 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
FAM227BQ96M60 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
FAM227BQ96M60 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
FAM227BQ96M60 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
FAM227BQ96M60 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
FAM227BQ96M60 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
FAM227BQ96M60 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
FAM227BQ96M60 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
FAM227BQ96M60 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
FAM227BQ96M60 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
FAM227BQ96M60 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
FAM227BQ96M60 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
FAM227BQ96M60 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
FAM227BQ96M60 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
FAM227BQ96M60 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
FAM227BQ96M60 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FAM227BQ96M60 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FAM227BQ96M60 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FAM227BQ96M60 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
FAM227BQ96M60 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FAM227BQ96M60 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
FAM227BQ96M60 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FAM227BQ96M60 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
FAM227BQ96M60 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FAM227BQ96M60 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FAM227BQ96M60 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FAM227BQ96M60 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FAM227BQ96M60 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
FAM227BQ96M60 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
FAM227BQ96M60 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
FAM227BQ96M60 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FAM227BQ96M60 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FAM227BQ96M60 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
FAM227BQ96M60 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
FAM227BQ96M60 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FAM227BQ96M60 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
FAM227BQ96M60 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FAM227BQ96M60 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
FAM227BQ96M60 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FAM227BQ96M60 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FAM227BQ96M60 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
FAM227BQ96M60 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
FAM227BQ96M60 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FAM227BQ96M60 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms