Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT9

RNPC3, RNA-binding protein 40, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNPC3Q96LT9 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RNPC3Q96LT9 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RNPC3Q96LT9 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RNPC3Q96LT9 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
RNPC3Q96LT9 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RNPC3Q96LT9 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RNPC3Q96LT9 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RNPC3Q96LT9 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RNPC3Q96LT9 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RNPC3Q96LT9 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RNPC3Q96LT9 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RNPC3Q96LT9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RNPC3Q96LT9 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RNPC3Q96LT9 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RNPC3Q96LT9 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RNPC3Q96LT9 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
RNPC3Q96LT9 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RNPC3Q96LT9 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RNPC3Q96LT9 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RNPC3Q96LT9 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RNPC3Q96LT9 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RNPC3Q96LT9 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RNPC3Q96LT9 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RNPC3Q96LT9 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RNPC3Q96LT9 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RNPC3Q96LT9 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RNPC3Q96LT9 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RNPC3Q96LT9 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
RNPC3Q96LT9 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RNPC3Q96LT9 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RNPC3Q96LT9 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RNPC3Q96LT9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RNPC3Q96LT9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RNPC3Q96LT9 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RNPC3Q96LT9 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RNPC3Q96LT9 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RNPC3Q96LT9 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RNPC3Q96LT9 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
RNPC3Q96LT9 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RNPC3Q96LT9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RNPC3Q96LT9 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RNPC3Q96LT9 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RNPC3Q96LT9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RNPC3Q96LT9 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RNPC3Q96LT9 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RNPC3Q96LT9 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RNPC3Q96LT9 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RNPC3Q96LT9 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RNPC3Q96LT9 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RNPC3Q96LT9 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RNPC3Q96LT9 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RNPC3Q96LT9 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RNPC3Q96LT9 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RNPC3Q96LT9 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
RNPC3Q96LT9 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RNPC3Q96LT9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RNPC3Q96LT9 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RNPC3Q96LT9 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RNPC3Q96LT9 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
RNPC3Q96LT9 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RNPC3Q96LT9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RNPC3Q96LT9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
RNPC3Q96LT9 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
RNPC3Q96LT9 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RNPC3Q96LT9 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RNPC3Q96LT9 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RNPC3Q96LT9 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RNPC3Q96LT9 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
RNPC3Q96LT9 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RNPC3Q96LT9 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RNPC3Q96LT9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RNPC3Q96LT9 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RNPC3Q96LT9 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RNPC3Q96LT9 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RNPC3Q96LT9 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RNPC3Q96LT9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RNPC3Q96LT9 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RNPC3Q96LT9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RNPC3Q96LT9 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RNPC3Q96LT9 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
RNPC3Q96LT9 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
RNPC3Q96LT9 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RNPC3Q96LT9 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RNPC3Q96LT9 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RNPC3Q96LT9 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RNPC3Q96LT9 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
RNPC3Q96LT9 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RNPC3Q96LT9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RNPC3Q96LT9 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RNPC3Q96LT9 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RNPC3Q96LT9 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RNPC3Q96LT9 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RNPC3Q96LT9 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RNPC3Q96LT9 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
RNPC3Q96LT9 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RNPC3Q96LT9 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RNPC3Q96LT9 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RNPC3Q96LT9 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RNPC3Q96LT9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RNPC3Q96LT9 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
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