Protein–RNA interactions for Protein: Q96JG6

VPS50, Syndetin, humanhuman

Predictions only

Length 964 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS50Q96JG6 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VPS50Q96JG6 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VPS50Q96JG6 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VPS50Q96JG6 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
VPS50Q96JG6 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
VPS50Q96JG6 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
VPS50Q96JG6 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
VPS50Q96JG6 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS50Q96JG6 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS50Q96JG6 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS50Q96JG6 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS50Q96JG6 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS50Q96JG6 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS50Q96JG6 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS50Q96JG6 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS50Q96JG6 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS50Q96JG6 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS50Q96JG6 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS50Q96JG6 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS50Q96JG6 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS50Q96JG6 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS50Q96JG6 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS50Q96JG6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VPS50Q96JG6 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VPS50Q96JG6 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VPS50Q96JG6 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VPS50Q96JG6 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VPS50Q96JG6 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
VPS50Q96JG6 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VPS50Q96JG6 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VPS50Q96JG6 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
VPS50Q96JG6 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VPS50Q96JG6 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VPS50Q96JG6 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VPS50Q96JG6 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VPS50Q96JG6 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VPS50Q96JG6 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VPS50Q96JG6 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VPS50Q96JG6 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VPS50Q96JG6 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VPS50Q96JG6 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VPS50Q96JG6 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VPS50Q96JG6 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VPS50Q96JG6 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VPS50Q96JG6 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VPS50Q96JG6 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VPS50Q96JG6 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
VPS50Q96JG6 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VPS50Q96JG6 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VPS50Q96JG6 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VPS50Q96JG6 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VPS50Q96JG6 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VPS50Q96JG6 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VPS50Q96JG6 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VPS50Q96JG6 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VPS50Q96JG6 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VPS50Q96JG6 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VPS50Q96JG6 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VPS50Q96JG6 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VPS50Q96JG6 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VPS50Q96JG6 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VPS50Q96JG6 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VPS50Q96JG6 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VPS50Q96JG6 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VPS50Q96JG6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VPS50Q96JG6 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VPS50Q96JG6 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
VPS50Q96JG6 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VPS50Q96JG6 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VPS50Q96JG6 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
VPS50Q96JG6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VPS50Q96JG6 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VPS50Q96JG6 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VPS50Q96JG6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
VPS50Q96JG6 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
VPS50Q96JG6 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
VPS50Q96JG6 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VPS50Q96JG6 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VPS50Q96JG6 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VPS50Q96JG6 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VPS50Q96JG6 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VPS50Q96JG6 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VPS50Q96JG6 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VPS50Q96JG6 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
VPS50Q96JG6 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VPS50Q96JG6 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VPS50Q96JG6 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VPS50Q96JG6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VPS50Q96JG6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VPS50Q96JG6 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VPS50Q96JG6 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
VPS50Q96JG6 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VPS50Q96JG6 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
VPS50Q96JG6 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
VPS50Q96JG6 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VPS50Q96JG6 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VPS50Q96JG6 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
VPS50Q96JG6 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VPS50Q96JG6 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VPS50Q96JG6 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms