Protein–RNA interactions for Protein: Q96I99

SUCLG2, Succinate--CoA ligase [GDP-forming] subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUCLG2Q96I99 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SUCLG2Q96I99 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SUCLG2Q96I99 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SUCLG2Q96I99 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SUCLG2Q96I99 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SUCLG2Q96I99 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SUCLG2Q96I99 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SUCLG2Q96I99 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SUCLG2Q96I99 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SUCLG2Q96I99 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
SUCLG2Q96I99 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SUCLG2Q96I99 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SUCLG2Q96I99 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SUCLG2Q96I99 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SUCLG2Q96I99 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SUCLG2Q96I99 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SUCLG2Q96I99 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SUCLG2Q96I99 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SUCLG2Q96I99 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SUCLG2Q96I99 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SUCLG2Q96I99 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SUCLG2Q96I99 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SUCLG2Q96I99 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
SUCLG2Q96I99 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SUCLG2Q96I99 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SUCLG2Q96I99 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SUCLG2Q96I99 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SUCLG2Q96I99 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SUCLG2Q96I99 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SUCLG2Q96I99 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SUCLG2Q96I99 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
SUCLG2Q96I99 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SUCLG2Q96I99 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SUCLG2Q96I99 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SUCLG2Q96I99 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SUCLG2Q96I99 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SUCLG2Q96I99 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SUCLG2Q96I99 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SUCLG2Q96I99 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SUCLG2Q96I99 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SUCLG2Q96I99 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SUCLG2Q96I99 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SUCLG2Q96I99 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SUCLG2Q96I99 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SUCLG2Q96I99 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SUCLG2Q96I99 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SUCLG2Q96I99 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SUCLG2Q96I99 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SUCLG2Q96I99 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SUCLG2Q96I99 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SUCLG2Q96I99 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SUCLG2Q96I99 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SUCLG2Q96I99 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.15
SUCLG2Q96I99 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SUCLG2Q96I99 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SUCLG2Q96I99 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SUCLG2Q96I99 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SUCLG2Q96I99 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SUCLG2Q96I99 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
SUCLG2Q96I99 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SUCLG2Q96I99 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SUCLG2Q96I99 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SUCLG2Q96I99 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SUCLG2Q96I99 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SUCLG2Q96I99 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SUCLG2Q96I99 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SUCLG2Q96I99 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SUCLG2Q96I99 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SUCLG2Q96I99 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
SUCLG2Q96I99 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SUCLG2Q96I99 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SUCLG2Q96I99 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SUCLG2Q96I99 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
SUCLG2Q96I99 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SUCLG2Q96I99 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SUCLG2Q96I99 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SUCLG2Q96I99 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SUCLG2Q96I99 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SUCLG2Q96I99 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SUCLG2Q96I99 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SUCLG2Q96I99 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SUCLG2Q96I99 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SUCLG2Q96I99 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
SUCLG2Q96I99 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SUCLG2Q96I99 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SUCLG2Q96I99 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SUCLG2Q96I99 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SUCLG2Q96I99 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SUCLG2Q96I99 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SUCLG2Q96I99 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SUCLG2Q96I99 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
SUCLG2Q96I99 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SUCLG2Q96I99 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SUCLG2Q96I99 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SUCLG2Q96I99 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SUCLG2Q96I99 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SUCLG2Q96I99 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SUCLG2Q96I99 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SUCLG2Q96I99 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SUCLG2Q96I99 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms