Protein–RNA interactions for Protein: Q96FV3

TSPAN17, Tetraspanin-17, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN17Q96FV3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSPAN17Q96FV3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSPAN17Q96FV3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSPAN17Q96FV3 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TSPAN17Q96FV3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TSPAN17Q96FV3 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TSPAN17Q96FV3 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TSPAN17Q96FV3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TSPAN17Q96FV3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TSPAN17Q96FV3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TSPAN17Q96FV3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TSPAN17Q96FV3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TSPAN17Q96FV3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TSPAN17Q96FV3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TSPAN17Q96FV3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TSPAN17Q96FV3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TSPAN17Q96FV3 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TSPAN17Q96FV3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSPAN17Q96FV3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSPAN17Q96FV3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSPAN17Q96FV3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSPAN17Q96FV3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSPAN17Q96FV3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSPAN17Q96FV3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSPAN17Q96FV3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSPAN17Q96FV3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSPAN17Q96FV3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSPAN17Q96FV3 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TSPAN17Q96FV3 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TSPAN17Q96FV3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TSPAN17Q96FV3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TSPAN17Q96FV3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TSPAN17Q96FV3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TSPAN17Q96FV3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TSPAN17Q96FV3 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TSPAN17Q96FV3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TSPAN17Q96FV3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TSPAN17Q96FV3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TSPAN17Q96FV3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TSPAN17Q96FV3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSPAN17Q96FV3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSPAN17Q96FV3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSPAN17Q96FV3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSPAN17Q96FV3 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSPAN17Q96FV3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSPAN17Q96FV3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSPAN17Q96FV3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSPAN17Q96FV3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TSPAN17Q96FV3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TSPAN17Q96FV3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TSPAN17Q96FV3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSPAN17Q96FV3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSPAN17Q96FV3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSPAN17Q96FV3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSPAN17Q96FV3 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSPAN17Q96FV3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSPAN17Q96FV3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSPAN17Q96FV3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSPAN17Q96FV3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSPAN17Q96FV3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSPAN17Q96FV3 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSPAN17Q96FV3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSPAN17Q96FV3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSPAN17Q96FV3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSPAN17Q96FV3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSPAN17Q96FV3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSPAN17Q96FV3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSPAN17Q96FV3 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSPAN17Q96FV3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSPAN17Q96FV3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSPAN17Q96FV3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSPAN17Q96FV3 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSPAN17Q96FV3 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSPAN17Q96FV3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSPAN17Q96FV3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSPAN17Q96FV3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSPAN17Q96FV3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSPAN17Q96FV3 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSPAN17Q96FV3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSPAN17Q96FV3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TSPAN17Q96FV3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSPAN17Q96FV3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSPAN17Q96FV3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSPAN17Q96FV3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSPAN17Q96FV3 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSPAN17Q96FV3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSPAN17Q96FV3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TSPAN17Q96FV3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TSPAN17Q96FV3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSPAN17Q96FV3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSPAN17Q96FV3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSPAN17Q96FV3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSPAN17Q96FV3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSPAN17Q96FV3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSPAN17Q96FV3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSPAN17Q96FV3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSPAN17Q96FV3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSPAN17Q96FV3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSPAN17Q96FV3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSPAN17Q96FV3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms