Protein–RNA interactions for Protein: Q96EH3

MALSU1, Mitochondrial assembly of ribosomal large subunit protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MALSU1Q96EH3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MALSU1Q96EH3 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MALSU1Q96EH3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MALSU1Q96EH3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
MALSU1Q96EH3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
MALSU1Q96EH3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MALSU1Q96EH3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MALSU1Q96EH3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MALSU1Q96EH3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MALSU1Q96EH3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MALSU1Q96EH3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MALSU1Q96EH3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MALSU1Q96EH3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
MALSU1Q96EH3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MALSU1Q96EH3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MALSU1Q96EH3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
MALSU1Q96EH3 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MALSU1Q96EH3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MALSU1Q96EH3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MALSU1Q96EH3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MALSU1Q96EH3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MALSU1Q96EH3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MALSU1Q96EH3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MALSU1Q96EH3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MALSU1Q96EH3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MALSU1Q96EH3 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MALSU1Q96EH3 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MALSU1Q96EH3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MALSU1Q96EH3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MALSU1Q96EH3 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MALSU1Q96EH3 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MALSU1Q96EH3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MALSU1Q96EH3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MALSU1Q96EH3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MALSU1Q96EH3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MALSU1Q96EH3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MALSU1Q96EH3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MALSU1Q96EH3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MALSU1Q96EH3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
MALSU1Q96EH3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MALSU1Q96EH3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MALSU1Q96EH3 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MALSU1Q96EH3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MALSU1Q96EH3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MALSU1Q96EH3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MALSU1Q96EH3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MALSU1Q96EH3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MALSU1Q96EH3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MALSU1Q96EH3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MALSU1Q96EH3 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MALSU1Q96EH3 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MALSU1Q96EH3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MALSU1Q96EH3 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MALSU1Q96EH3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MALSU1Q96EH3 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MALSU1Q96EH3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
MALSU1Q96EH3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MALSU1Q96EH3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MALSU1Q96EH3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
MALSU1Q96EH3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
MALSU1Q96EH3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MALSU1Q96EH3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MALSU1Q96EH3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MALSU1Q96EH3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MALSU1Q96EH3 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MALSU1Q96EH3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MALSU1Q96EH3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MALSU1Q96EH3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MALSU1Q96EH3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MALSU1Q96EH3 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MALSU1Q96EH3 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MALSU1Q96EH3 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MALSU1Q96EH3 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MALSU1Q96EH3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MALSU1Q96EH3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MALSU1Q96EH3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MALSU1Q96EH3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MALSU1Q96EH3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MALSU1Q96EH3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MALSU1Q96EH3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MALSU1Q96EH3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MALSU1Q96EH3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MALSU1Q96EH3 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MALSU1Q96EH3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MALSU1Q96EH3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MALSU1Q96EH3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MALSU1Q96EH3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MALSU1Q96EH3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MALSU1Q96EH3 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MALSU1Q96EH3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MALSU1Q96EH3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
MALSU1Q96EH3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MALSU1Q96EH3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MALSU1Q96EH3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
MALSU1Q96EH3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MALSU1Q96EH3 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MALSU1Q96EH3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MALSU1Q96EH3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MALSU1Q96EH3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MALSU1Q96EH3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms