Protein–RNA interactions for Protein: Q96C57

C12orf43, Uncharacterized protein C12orf43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf43Q96C57 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
C12orf43Q96C57 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
C12orf43Q96C57 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
C12orf43Q96C57 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
C12orf43Q96C57 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
C12orf43Q96C57 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
C12orf43Q96C57 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
C12orf43Q96C57 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
C12orf43Q96C57 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
C12orf43Q96C57 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
C12orf43Q96C57 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
C12orf43Q96C57 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
C12orf43Q96C57 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
C12orf43Q96C57 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
C12orf43Q96C57 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
C12orf43Q96C57 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
C12orf43Q96C57 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
C12orf43Q96C57 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
C12orf43Q96C57 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
C12orf43Q96C57 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
C12orf43Q96C57 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
C12orf43Q96C57 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
C12orf43Q96C57 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
C12orf43Q96C57 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
C12orf43Q96C57 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
C12orf43Q96C57 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
C12orf43Q96C57 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
C12orf43Q96C57 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
C12orf43Q96C57 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
C12orf43Q96C57 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
C12orf43Q96C57 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
C12orf43Q96C57 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
C12orf43Q96C57 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
C12orf43Q96C57 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
C12orf43Q96C57 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
C12orf43Q96C57 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
C12orf43Q96C57 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
C12orf43Q96C57 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
C12orf43Q96C57 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
C12orf43Q96C57 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
C12orf43Q96C57 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
C12orf43Q96C57 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
C12orf43Q96C57 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
C12orf43Q96C57 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
C12orf43Q96C57 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
C12orf43Q96C57 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
C12orf43Q96C57 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
C12orf43Q96C57 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
C12orf43Q96C57 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
C12orf43Q96C57 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
C12orf43Q96C57 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
C12orf43Q96C57 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
C12orf43Q96C57 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
C12orf43Q96C57 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
C12orf43Q96C57 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
C12orf43Q96C57 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
C12orf43Q96C57 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
C12orf43Q96C57 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
C12orf43Q96C57 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
C12orf43Q96C57 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
C12orf43Q96C57 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
C12orf43Q96C57 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
C12orf43Q96C57 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
C12orf43Q96C57 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
C12orf43Q96C57 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
C12orf43Q96C57 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
C12orf43Q96C57 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
C12orf43Q96C57 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
C12orf43Q96C57 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
C12orf43Q96C57 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
C12orf43Q96C57 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
C12orf43Q96C57 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
C12orf43Q96C57 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
C12orf43Q96C57 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
C12orf43Q96C57 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
C12orf43Q96C57 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
C12orf43Q96C57 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
C12orf43Q96C57 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
C12orf43Q96C57 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
C12orf43Q96C57 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
C12orf43Q96C57 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
C12orf43Q96C57 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
C12orf43Q96C57 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
C12orf43Q96C57 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
C12orf43Q96C57 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
C12orf43Q96C57 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
C12orf43Q96C57 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
C12orf43Q96C57 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
C12orf43Q96C57 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
C12orf43Q96C57 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
C12orf43Q96C57 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
C12orf43Q96C57 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
C12orf43Q96C57 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
C12orf43Q96C57 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
C12orf43Q96C57 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
C12orf43Q96C57 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
C12orf43Q96C57 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
C12orf43Q96C57 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
C12orf43Q96C57 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
C12orf43Q96C57 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms