Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ5

CCDC127, Coiled-coil domain-containing protein 127, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC127Q96BQ5 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC127Q96BQ5 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC127Q96BQ5 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC127Q96BQ5 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC127Q96BQ5 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC127Q96BQ5 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC127Q96BQ5 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC127Q96BQ5 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC127Q96BQ5 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC127Q96BQ5 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC127Q96BQ5 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC127Q96BQ5 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC127Q96BQ5 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC127Q96BQ5 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC127Q96BQ5 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC127Q96BQ5 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC127Q96BQ5 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC127Q96BQ5 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC127Q96BQ5 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC127Q96BQ5 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC127Q96BQ5 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC127Q96BQ5 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC127Q96BQ5 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC127Q96BQ5 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC127Q96BQ5 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC127Q96BQ5 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC127Q96BQ5 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC127Q96BQ5 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC127Q96BQ5 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC127Q96BQ5 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC127Q96BQ5 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC127Q96BQ5 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC127Q96BQ5 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC127Q96BQ5 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC127Q96BQ5 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC127Q96BQ5 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC127Q96BQ5 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC127Q96BQ5 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC127Q96BQ5 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC127Q96BQ5 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC127Q96BQ5 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC127Q96BQ5 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC127Q96BQ5 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC127Q96BQ5 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC127Q96BQ5 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC127Q96BQ5 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC127Q96BQ5 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC127Q96BQ5 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC127Q96BQ5 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC127Q96BQ5 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC127Q96BQ5 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC127Q96BQ5 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC127Q96BQ5 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC127Q96BQ5 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC127Q96BQ5 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC127Q96BQ5 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC127Q96BQ5 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC127Q96BQ5 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC127Q96BQ5 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC127Q96BQ5 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC127Q96BQ5 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC127Q96BQ5 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC127Q96BQ5 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC127Q96BQ5 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC127Q96BQ5 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC127Q96BQ5 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC127Q96BQ5 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC127Q96BQ5 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC127Q96BQ5 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC127Q96BQ5 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC127Q96BQ5 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC127Q96BQ5 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC127Q96BQ5 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC127Q96BQ5 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC127Q96BQ5 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC127Q96BQ5 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC127Q96BQ5 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC127Q96BQ5 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC127Q96BQ5 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC127Q96BQ5 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC127Q96BQ5 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC127Q96BQ5 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC127Q96BQ5 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC127Q96BQ5 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC127Q96BQ5 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC127Q96BQ5 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC127Q96BQ5 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC127Q96BQ5 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC127Q96BQ5 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC127Q96BQ5 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC127Q96BQ5 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC127Q96BQ5 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC127Q96BQ5 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC127Q96BQ5 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC127Q96BQ5 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC127Q96BQ5 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC127Q96BQ5 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC127Q96BQ5 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC127Q96BQ5 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC127Q96BQ5 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms