Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW59

SPRYD4, SPRY domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRYD4Q8WW59 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SPRYD4Q8WW59 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SPRYD4Q8WW59 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SPRYD4Q8WW59 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SPRYD4Q8WW59 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SPRYD4Q8WW59 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SPRYD4Q8WW59 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SPRYD4Q8WW59 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SPRYD4Q8WW59 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SPRYD4Q8WW59 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SPRYD4Q8WW59 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SPRYD4Q8WW59 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SPRYD4Q8WW59 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SPRYD4Q8WW59 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SPRYD4Q8WW59 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SPRYD4Q8WW59 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SPRYD4Q8WW59 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SPRYD4Q8WW59 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SPRYD4Q8WW59 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SPRYD4Q8WW59 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SPRYD4Q8WW59 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SPRYD4Q8WW59 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SPRYD4Q8WW59 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SPRYD4Q8WW59 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SPRYD4Q8WW59 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SPRYD4Q8WW59 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SPRYD4Q8WW59 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPRYD4Q8WW59 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPRYD4Q8WW59 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPRYD4Q8WW59 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SPRYD4Q8WW59 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPRYD4Q8WW59 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPRYD4Q8WW59 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPRYD4Q8WW59 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPRYD4Q8WW59 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPRYD4Q8WW59 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPRYD4Q8WW59 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPRYD4Q8WW59 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPRYD4Q8WW59 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SPRYD4Q8WW59 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPRYD4Q8WW59 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPRYD4Q8WW59 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SPRYD4Q8WW59 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPRYD4Q8WW59 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPRYD4Q8WW59 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPRYD4Q8WW59 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPRYD4Q8WW59 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPRYD4Q8WW59 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPRYD4Q8WW59 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPRYD4Q8WW59 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPRYD4Q8WW59 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPRYD4Q8WW59 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPRYD4Q8WW59 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPRYD4Q8WW59 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPRYD4Q8WW59 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPRYD4Q8WW59 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPRYD4Q8WW59 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPRYD4Q8WW59 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPRYD4Q8WW59 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPRYD4Q8WW59 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPRYD4Q8WW59 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPRYD4Q8WW59 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SPRYD4Q8WW59 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPRYD4Q8WW59 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPRYD4Q8WW59 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPRYD4Q8WW59 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPRYD4Q8WW59 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPRYD4Q8WW59 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPRYD4Q8WW59 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPRYD4Q8WW59 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPRYD4Q8WW59 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPRYD4Q8WW59 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPRYD4Q8WW59 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPRYD4Q8WW59 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPRYD4Q8WW59 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPRYD4Q8WW59 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPRYD4Q8WW59 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPRYD4Q8WW59 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPRYD4Q8WW59 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPRYD4Q8WW59 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPRYD4Q8WW59 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPRYD4Q8WW59 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SPRYD4Q8WW59 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SPRYD4Q8WW59 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SPRYD4Q8WW59 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SPRYD4Q8WW59 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SPRYD4Q8WW59 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SPRYD4Q8WW59 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SPRYD4Q8WW59 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SPRYD4Q8WW59 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SPRYD4Q8WW59 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SPRYD4Q8WW59 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SPRYD4Q8WW59 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SPRYD4Q8WW59 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SPRYD4Q8WW59 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SPRYD4Q8WW59 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPRYD4Q8WW59 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPRYD4Q8WW59 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPRYD4Q8WW59 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPRYD4Q8WW59 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms