Protein–RNA interactions for Protein: Q8TB72

PUM2, Pumilio homolog 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM2Q8TB72 CASP3-206ENST00000523916 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.854e-39■■■■■ 51
PUM2Q8TB72 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.929e-12■■■■■ 51
PUM2Q8TB72 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.189e-12■■■■■ 51
PUM2Q8TB72 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.633e-7■■■■■ 50.9
PUM2Q8TB72 SMG7-209ENST00000495321 556 ntTSL 36.58□□□□□ -1.362e-10■■■■■ 50.9
PUM2Q8TB72 ADAM15-218ENST00000474709 731 ntTSL 520.81■□□□□ 0.921e-16■■■■■ 50.9
PUM2Q8TB72 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.072e-7■■■■■ 50.8
PUM2Q8TB72 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.042e-7■■■■■ 50.8
PUM2Q8TB72 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.042e-7■■■■■ 50.8
PUM2Q8TB72 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.092e-7■■■■■ 50.8
PUM2Q8TB72 TEX30-204ENST00000376027 1106 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.292e-7■■■■■ 50.8
PUM2Q8TB72 TEX30-201ENST00000376019 1689 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.752e-7■■■■■ 50.8
PUM2Q8TB72 SLC38A2-208ENST00000549258 4384 ntTSL 23.98□□□□□ -1.773e-56■■■■■ 50.8
PUM2Q8TB72 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.884e-14■■■■■ 50.7
PUM2Q8TB72 ANKRD28-202ENST00000412318 4408 ntTSL 24.22□□□□□ -1.734e-14■■■■■ 50.7
PUM2Q8TB72 ANKRD28-215ENST00000624145 6383 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.784e-14■■■■■ 50.7
PUM2Q8TB72 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.666e-7■■■■■ 50.7
PUM2Q8TB72 TAF4-203ENST00000474089 532 ntTSL 217.79■□□□□ 0.446e-7■■■■■ 50.7
PUM2Q8TB72 TBC1D31-201ENST00000287380 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.452e-6■■■■■ 50.7
PUM2Q8TB72 TBC1D31-210ENST00000521676 3256 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.762e-6■■■■■ 50.7
PUM2Q8TB72 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.892e-6■■■■■ 50.7
PUM2Q8TB72 TBC1D31-215ENST00000524307 3101 ntTSL 21.89□□□□□ -2.112e-6■■■■■ 50.7
PUM2Q8TB72 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.611e-323■■■■■ 50.6
PUM2Q8TB72 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.041e-323■■■■■ 50.6
PUM2Q8TB72 WDHD1-201ENST00000360586 5996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.64e-9■■■■■ 50.6
PUM2Q8TB72 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.283e-13■■■■■ 50.5
PUM2Q8TB72 POFUT1-203ENST00000434904 493 ntTSL 54.88□□□□□ -1.633e-13■■■■■ 50.5
PUM2Q8TB72 KLHDC2-207ENST00000555443 1756 ntTSL 219.65■□□□□ 0.742e-8■■■■■ 50.5
PUM2Q8TB72 KLHDC2-208ENST00000555739 1696 ntTSL 519.13■□□□□ 0.652e-8■■■■■ 50.5
PUM2Q8TB72 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.612e-8■■■■■ 50.5
PUM2Q8TB72 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.032e-8■■■■■ 50.5
PUM2Q8TB72 KLHDC2-211ENST00000557247 1565 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.572e-8■■■■■ 50.5
PUM2Q8TB72 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.141e-323■■■■■ 50.5
PUM2Q8TB72 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.411e-323■■■■■ 50.5
PUM2Q8TB72 RPL19-201ENST00000225430 732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.851e-323■■■■■ 50.5
PUM2Q8TB72 RPL19-205ENST00000579374 690 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.851e-323■■■■■ 50.5
PUM2Q8TB72 RPL19-203ENST00000577759 564 nt9.27□□□□□ -0.931e-323■■■■■ 50.5
PUM2Q8TB72 TANK-211ENST00000439442 727 ntTSL 36.31□□□□□ -1.42e-6■■■■■ 50.5
PUM2Q8TB72 TANK-206ENST00000406287 875 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.472e-6■■■■■ 50.5
PUM2Q8TB72 TANK-203ENST00000402568 878 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.662e-6■■■■■ 50.5
PUM2Q8TB72 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.032e-15■■■■■ 50.5
PUM2Q8TB72 AKAP9-216ENST00000619023 6006 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.672e-15■■■■■ 50.5
PUM2Q8TB72 AKAP9-214ENST00000493453 6020 ntTSL 28.64□□□□□ -1.032e-15■■■■■ 50.5
PUM2Q8TB72 AKAP9-207ENST00000438114 696 ntTSL 26.46□□□□□ -1.382e-15■■■■■ 50.5
PUM2Q8TB72 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.982e-15■■■■■ 50.5
PUM2Q8TB72 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.922e-12■■■■■ 50.4
PUM2Q8TB72 C6orf136-204ENST00000446773 1496 ntTSL 1 (best)18.4■□□□□ 0.542e-12■■■■■ 50.4
PUM2Q8TB72 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.172e-12■■■■■ 50.4
PUM2Q8TB72 C6orf136-212ENST00000488383 1337 ntTSL 514.48□□□□□ -0.092e-12■■■■■ 50.4
PUM2Q8TB72 C6orf136-208ENST00000467801 583 ntTSL 212.18□□□□□ -0.462e-12■■■■■ 50.4
PUM2Q8TB72 C6orf136-209ENST00000468785 492 ntTSL 210.88□□□□□ -0.672e-12■■■■■ 50.4
PUM2Q8TB72 C6orf136-207ENST00000465699 692 ntTSL 310.24□□□□□ -0.772e-12■■■■■ 50.4
PUM2Q8TB72 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.143e-72■■■■■ 50.3
PUM2Q8TB72 BTBD2-210ENST00000592895 2763 ntTSL 217.87■□□□□ 0.453e-72■■■■■ 50.3
PUM2Q8TB72 BTBD2-207ENST00000589685 2422 ntTSL 1 (best)17.56■□□□□ 0.43e-72■■■■■ 50.3
PUM2Q8TB72 RNF216-205ENST00000425013 5639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.416e-10■■■■■ 50.3
PUM2Q8TB72 ATF7IP-222ENST00000544627 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.272e-14■■■■■ 50.3
PUM2Q8TB72 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -08e-11■■■■■ 50.3
PUM2Q8TB72 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.39□□□□□ -2.198e-11■■■■■ 50.3
PUM2Q8TB72 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.082e-24■■■■■ 50.2
PUM2Q8TB72 UBE2G1-201ENST00000396981 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.522e-24■■■■■ 50.2
PUM2Q8TB72 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.377e-10■■■■■ 50.2
PUM2Q8TB72 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.17e-10■■■■■ 50.2
PUM2Q8TB72 PUM1-202ENST00000373741 4242 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.672e-42■■■■■ 50.1
PUM2Q8TB72 PUM1-211ENST00000498419 3068 ntTSL 56.47□□□□□ -1.372e-42■■■■■ 50.1
PUM2Q8TB72 PUM1-206ENST00000426105 4043 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.422e-42■■■■■ 50.1
PUM2Q8TB72 PUM1-207ENST00000440538 3936 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.482e-42■■■■■ 50.1
PUM2Q8TB72 EEF2-201ENST00000309311 3164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.631e-80■■■■■ 49.9
PUM2Q8TB72 COCH-209ENST00000555881 782 ntTSL 220.42■□□□□ 0.862e-8■■■■■ 49.9
PUM2Q8TB72 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.473e-6■■■■■ 49.8
PUM2Q8TB72 INSIG1-205ENST00000468307 852 ntTSL 56.38□□□□□ -1.393e-58■■■■■ 49.8
PUM2Q8TB72 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.021e-6■■■■■ 49.7
PUM2Q8TB72 LONRF1-205ENST00000526680 2841 ntTSL 1 (best)10.66□□□□□ -0.71e-6■■■■■ 49.7
PUM2Q8TB72 SOGA1-204ENST00000465671 4478 ntTSL 212.45□□□□□ -0.421e-8■■■■■ 49.7
PUM2Q8TB72 NELFA-205ENST00000416258 2188 ntTSL 517.96■□□□□ 0.462e-13■■■■■ 49.7
PUM2Q8TB72 NELFA-201ENST00000333877 2228 ntTSL 217.8■□□□□ 0.442e-13■■■■■ 49.7
PUM2Q8TB72 NELFA-213ENST00000467661 1707 ntTSL 1 (best)16.92■□□□□ 0.32e-13■■■■■ 49.7
PUM2Q8TB72 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.182e-13■■■■■ 49.7
PUM2Q8TB72 NELFA-212ENST00000463820 2495 ntTSL 216.12■□□□□ 0.172e-13■■■■■ 49.7
PUM2Q8TB72 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.062e-13■■■■■ 49.7
PUM2Q8TB72 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.152e-13■■■■■ 49.7
PUM2Q8TB72 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.033e-12■■■■■ 49.7
PUM2Q8TB72 CHAF1A-207ENST00000589648 563 ntTSL 513.09□□□□□ -0.313e-12■■■■■ 49.7
PUM2Q8TB72 F2R-201ENST00000319211 3821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.536e-7■■■■■ 49.6
PUM2Q8TB72 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.152e-14■■■■■ 49.6
PUM2Q8TB72 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.152e-14■■■■■ 49.6
PUM2Q8TB72 ARFGEF2-201ENST00000371917 8852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.561e-6■■■■■ 49.5
PUM2Q8TB72 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.083e-6■■■■■ 49.5
PUM2Q8TB72 UBIAD1-204ENST00000486588 831 ntTSL 513.39□□□□□ -0.273e-6■■■■■ 49.5
PUM2Q8TB72 UBIAD1-201ENST00000376804 825 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.413e-6■■■■■ 49.5
PUM2Q8TB72 UBIAD1-202ENST00000376810 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.573e-6■■■■■ 49.5
PUM2Q8TB72 UBIAD1-203ENST00000483738 1393 ntTSL 39.63□□□□□ -0.873e-6■■■■■ 49.5
PUM2Q8TB72 PEAK1-201ENST00000312493 11512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.555e-8■■■■■ 49.5
PUM2Q8TB72 PEAK1-204ENST00000560626 19217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.615e-8■■■■■ 49.5
PUM2Q8TB72 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.531e-16■■■■■ 49.4
PUM2Q8TB72 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.421e-16■■■■■ 49.4
PUM2Q8TB72 CLK2-205ENST00000476983 1885 ntTSL 1 (best)18.85■□□□□ 0.611e-16■■■■■ 49.4
PUM2Q8TB72 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.291e-16■■■■■ 49.4
PUM2Q8TB72 CLK2-207ENST00000497188 2702 ntTSL 211.05□□□□□ -0.641e-16■■■■■ 49.4
PUM2Q8TB72 SOGA1-201ENST00000237536 14371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.441e-7■■■■■ 49.4
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