Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHU2

CFAP61, Cilia- and flagella-associated protein 61, humanhuman

Predictions only

Length 1,237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP61Q8NHU2 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CFAP61Q8NHU2 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CFAP61Q8NHU2 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CFAP61Q8NHU2 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CFAP61Q8NHU2 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CFAP61Q8NHU2 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CFAP61Q8NHU2 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CFAP61Q8NHU2 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CFAP61Q8NHU2 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CFAP61Q8NHU2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CFAP61Q8NHU2 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CFAP61Q8NHU2 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CFAP61Q8NHU2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CFAP61Q8NHU2 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CFAP61Q8NHU2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CFAP61Q8NHU2 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CFAP61Q8NHU2 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CFAP61Q8NHU2 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CFAP61Q8NHU2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CFAP61Q8NHU2 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CFAP61Q8NHU2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CFAP61Q8NHU2 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CFAP61Q8NHU2 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CFAP61Q8NHU2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CFAP61Q8NHU2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CFAP61Q8NHU2 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CFAP61Q8NHU2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CFAP61Q8NHU2 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CFAP61Q8NHU2 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CFAP61Q8NHU2 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CFAP61Q8NHU2 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CFAP61Q8NHU2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CFAP61Q8NHU2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CFAP61Q8NHU2 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CFAP61Q8NHU2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CFAP61Q8NHU2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CFAP61Q8NHU2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CFAP61Q8NHU2 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CFAP61Q8NHU2 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CFAP61Q8NHU2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CFAP61Q8NHU2 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CFAP61Q8NHU2 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CFAP61Q8NHU2 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CFAP61Q8NHU2 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CFAP61Q8NHU2 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CFAP61Q8NHU2 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CFAP61Q8NHU2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CFAP61Q8NHU2 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CFAP61Q8NHU2 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CFAP61Q8NHU2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CFAP61Q8NHU2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CFAP61Q8NHU2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CFAP61Q8NHU2 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CFAP61Q8NHU2 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CFAP61Q8NHU2 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CFAP61Q8NHU2 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CFAP61Q8NHU2 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CFAP61Q8NHU2 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CFAP61Q8NHU2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CFAP61Q8NHU2 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CFAP61Q8NHU2 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CFAP61Q8NHU2 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CFAP61Q8NHU2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CFAP61Q8NHU2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CFAP61Q8NHU2 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CFAP61Q8NHU2 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CFAP61Q8NHU2 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CFAP61Q8NHU2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFAP61Q8NHU2 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFAP61Q8NHU2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFAP61Q8NHU2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFAP61Q8NHU2 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CFAP61Q8NHU2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFAP61Q8NHU2 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFAP61Q8NHU2 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFAP61Q8NHU2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFAP61Q8NHU2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFAP61Q8NHU2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFAP61Q8NHU2 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFAP61Q8NHU2 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFAP61Q8NHU2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFAP61Q8NHU2 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFAP61Q8NHU2 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CFAP61Q8NHU2 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CFAP61Q8NHU2 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CFAP61Q8NHU2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CFAP61Q8NHU2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CFAP61Q8NHU2 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CFAP61Q8NHU2 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CFAP61Q8NHU2 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CFAP61Q8NHU2 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CFAP61Q8NHU2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CFAP61Q8NHU2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CFAP61Q8NHU2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CFAP61Q8NHU2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CFAP61Q8NHU2 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CFAP61Q8NHU2 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CFAP61Q8NHU2 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CFAP61Q8NHU2 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CFAP61Q8NHU2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms