Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEY3

SPATA4, Spermatogenesis-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA4Q8NEY3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPATA4Q8NEY3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SPATA4Q8NEY3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPATA4Q8NEY3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPATA4Q8NEY3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPATA4Q8NEY3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPATA4Q8NEY3 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPATA4Q8NEY3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPATA4Q8NEY3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPATA4Q8NEY3 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPATA4Q8NEY3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SPATA4Q8NEY3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPATA4Q8NEY3 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPATA4Q8NEY3 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPATA4Q8NEY3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPATA4Q8NEY3 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPATA4Q8NEY3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPATA4Q8NEY3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPATA4Q8NEY3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPATA4Q8NEY3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPATA4Q8NEY3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPATA4Q8NEY3 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPATA4Q8NEY3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPATA4Q8NEY3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPATA4Q8NEY3 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPATA4Q8NEY3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPATA4Q8NEY3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SPATA4Q8NEY3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPATA4Q8NEY3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPATA4Q8NEY3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPATA4Q8NEY3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPATA4Q8NEY3 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPATA4Q8NEY3 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPATA4Q8NEY3 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPATA4Q8NEY3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SPATA4Q8NEY3 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPATA4Q8NEY3 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPATA4Q8NEY3 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPATA4Q8NEY3 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPATA4Q8NEY3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPATA4Q8NEY3 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPATA4Q8NEY3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPATA4Q8NEY3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPATA4Q8NEY3 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPATA4Q8NEY3 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SPATA4Q8NEY3 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SPATA4Q8NEY3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SPATA4Q8NEY3 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SPATA4Q8NEY3 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SPATA4Q8NEY3 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SPATA4Q8NEY3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SPATA4Q8NEY3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SPATA4Q8NEY3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SPATA4Q8NEY3 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPATA4Q8NEY3 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPATA4Q8NEY3 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPATA4Q8NEY3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPATA4Q8NEY3 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPATA4Q8NEY3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPATA4Q8NEY3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPATA4Q8NEY3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPATA4Q8NEY3 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SPATA4Q8NEY3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPATA4Q8NEY3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPATA4Q8NEY3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPATA4Q8NEY3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPATA4Q8NEY3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPATA4Q8NEY3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SPATA4Q8NEY3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPATA4Q8NEY3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPATA4Q8NEY3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPATA4Q8NEY3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPATA4Q8NEY3 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPATA4Q8NEY3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPATA4Q8NEY3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPATA4Q8NEY3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPATA4Q8NEY3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPATA4Q8NEY3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPATA4Q8NEY3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPATA4Q8NEY3 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPATA4Q8NEY3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPATA4Q8NEY3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPATA4Q8NEY3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPATA4Q8NEY3 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SPATA4Q8NEY3 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SPATA4Q8NEY3 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SPATA4Q8NEY3 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SPATA4Q8NEY3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SPATA4Q8NEY3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SPATA4Q8NEY3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SPATA4Q8NEY3 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SPATA4Q8NEY3 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SPATA4Q8NEY3 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SPATA4Q8NEY3 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SPATA4Q8NEY3 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SPATA4Q8NEY3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SPATA4Q8NEY3 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SPATA4Q8NEY3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SPATA4Q8NEY3 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SPATA4Q8NEY3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms