Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEU8

APPL2, DCC-interacting protein 13-beta, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APPL2Q8NEU8 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
APPL2Q8NEU8 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
APPL2Q8NEU8 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
APPL2Q8NEU8 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
APPL2Q8NEU8 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
APPL2Q8NEU8 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
APPL2Q8NEU8 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
APPL2Q8NEU8 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
APPL2Q8NEU8 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
APPL2Q8NEU8 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
APPL2Q8NEU8 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
APPL2Q8NEU8 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
APPL2Q8NEU8 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
APPL2Q8NEU8 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
APPL2Q8NEU8 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
APPL2Q8NEU8 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
APPL2Q8NEU8 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
APPL2Q8NEU8 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
APPL2Q8NEU8 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
APPL2Q8NEU8 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
APPL2Q8NEU8 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
APPL2Q8NEU8 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
APPL2Q8NEU8 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
APPL2Q8NEU8 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
APPL2Q8NEU8 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
APPL2Q8NEU8 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
APPL2Q8NEU8 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
APPL2Q8NEU8 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
APPL2Q8NEU8 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
APPL2Q8NEU8 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
APPL2Q8NEU8 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
APPL2Q8NEU8 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
APPL2Q8NEU8 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
APPL2Q8NEU8 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
APPL2Q8NEU8 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
APPL2Q8NEU8 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
APPL2Q8NEU8 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
APPL2Q8NEU8 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
APPL2Q8NEU8 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
APPL2Q8NEU8 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
APPL2Q8NEU8 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
APPL2Q8NEU8 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
APPL2Q8NEU8 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
APPL2Q8NEU8 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
APPL2Q8NEU8 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
APPL2Q8NEU8 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
APPL2Q8NEU8 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
APPL2Q8NEU8 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
APPL2Q8NEU8 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
APPL2Q8NEU8 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
APPL2Q8NEU8 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
APPL2Q8NEU8 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
APPL2Q8NEU8 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
APPL2Q8NEU8 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
APPL2Q8NEU8 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
APPL2Q8NEU8 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
APPL2Q8NEU8 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
APPL2Q8NEU8 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
APPL2Q8NEU8 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
APPL2Q8NEU8 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
APPL2Q8NEU8 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
APPL2Q8NEU8 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
APPL2Q8NEU8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
APPL2Q8NEU8 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
APPL2Q8NEU8 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
APPL2Q8NEU8 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
APPL2Q8NEU8 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
APPL2Q8NEU8 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
APPL2Q8NEU8 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
APPL2Q8NEU8 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
APPL2Q8NEU8 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
APPL2Q8NEU8 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
APPL2Q8NEU8 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
APPL2Q8NEU8 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
APPL2Q8NEU8 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
APPL2Q8NEU8 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
APPL2Q8NEU8 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
APPL2Q8NEU8 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
APPL2Q8NEU8 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
APPL2Q8NEU8 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
APPL2Q8NEU8 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
APPL2Q8NEU8 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
APPL2Q8NEU8 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
APPL2Q8NEU8 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
APPL2Q8NEU8 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
APPL2Q8NEU8 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
APPL2Q8NEU8 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
APPL2Q8NEU8 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
APPL2Q8NEU8 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
APPL2Q8NEU8 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
APPL2Q8NEU8 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
APPL2Q8NEU8 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
APPL2Q8NEU8 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
APPL2Q8NEU8 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
APPL2Q8NEU8 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
APPL2Q8NEU8 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
APPL2Q8NEU8 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
APPL2Q8NEU8 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
APPL2Q8NEU8 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
APPL2Q8NEU8 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms