Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND30

PPFIBP2, Liprin-beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIBP2Q8ND30 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPFIBP2Q8ND30 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPFIBP2Q8ND30 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPFIBP2Q8ND30 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPFIBP2Q8ND30 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPFIBP2Q8ND30 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPFIBP2Q8ND30 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPFIBP2Q8ND30 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPFIBP2Q8ND30 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPFIBP2Q8ND30 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPFIBP2Q8ND30 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPFIBP2Q8ND30 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPFIBP2Q8ND30 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPFIBP2Q8ND30 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPFIBP2Q8ND30 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPFIBP2Q8ND30 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPFIBP2Q8ND30 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPFIBP2Q8ND30 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPFIBP2Q8ND30 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPFIBP2Q8ND30 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPFIBP2Q8ND30 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPFIBP2Q8ND30 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPFIBP2Q8ND30 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPFIBP2Q8ND30 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPFIBP2Q8ND30 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPFIBP2Q8ND30 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPFIBP2Q8ND30 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPFIBP2Q8ND30 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPFIBP2Q8ND30 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPFIBP2Q8ND30 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPFIBP2Q8ND30 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPFIBP2Q8ND30 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPFIBP2Q8ND30 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPFIBP2Q8ND30 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPFIBP2Q8ND30 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPFIBP2Q8ND30 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPFIBP2Q8ND30 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPFIBP2Q8ND30 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPFIBP2Q8ND30 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPFIBP2Q8ND30 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPFIBP2Q8ND30 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPFIBP2Q8ND30 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPFIBP2Q8ND30 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPFIBP2Q8ND30 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPFIBP2Q8ND30 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPFIBP2Q8ND30 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPFIBP2Q8ND30 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPFIBP2Q8ND30 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PPFIBP2Q8ND30 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPFIBP2Q8ND30 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPFIBP2Q8ND30 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPFIBP2Q8ND30 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPFIBP2Q8ND30 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPFIBP2Q8ND30 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPFIBP2Q8ND30 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPFIBP2Q8ND30 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPFIBP2Q8ND30 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPFIBP2Q8ND30 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPFIBP2Q8ND30 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPFIBP2Q8ND30 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPFIBP2Q8ND30 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPFIBP2Q8ND30 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPFIBP2Q8ND30 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPFIBP2Q8ND30 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPFIBP2Q8ND30 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPFIBP2Q8ND30 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPFIBP2Q8ND30 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PPFIBP2Q8ND30 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPFIBP2Q8ND30 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPFIBP2Q8ND30 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PPFIBP2Q8ND30 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PPFIBP2Q8ND30 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPFIBP2Q8ND30 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPFIBP2Q8ND30 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPFIBP2Q8ND30 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPFIBP2Q8ND30 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PPFIBP2Q8ND30 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPFIBP2Q8ND30 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPFIBP2Q8ND30 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPFIBP2Q8ND30 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPFIBP2Q8ND30 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPFIBP2Q8ND30 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPFIBP2Q8ND30 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPFIBP2Q8ND30 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPFIBP2Q8ND30 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPFIBP2Q8ND30 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPFIBP2Q8ND30 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPFIBP2Q8ND30 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPFIBP2Q8ND30 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPFIBP2Q8ND30 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPFIBP2Q8ND30 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPFIBP2Q8ND30 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPFIBP2Q8ND30 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPFIBP2Q8ND30 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPFIBP2Q8ND30 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PPFIBP2Q8ND30 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPFIBP2Q8ND30 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPFIBP2Q8ND30 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPFIBP2Q8ND30 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPFIBP2Q8ND30 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms