Protein–RNA interactions for Protein: Q8NC42

RNF149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF149Q8NC42 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RNF149Q8NC42 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RNF149Q8NC42 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
RNF149Q8NC42 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RNF149Q8NC42 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RNF149Q8NC42 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RNF149Q8NC42 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RNF149Q8NC42 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RNF149Q8NC42 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RNF149Q8NC42 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RNF149Q8NC42 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RNF149Q8NC42 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RNF149Q8NC42 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RNF149Q8NC42 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RNF149Q8NC42 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RNF149Q8NC42 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
RNF149Q8NC42 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RNF149Q8NC42 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
RNF149Q8NC42 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RNF149Q8NC42 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RNF149Q8NC42 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RNF149Q8NC42 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RNF149Q8NC42 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
RNF149Q8NC42 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
RNF149Q8NC42 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RNF149Q8NC42 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RNF149Q8NC42 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RNF149Q8NC42 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RNF149Q8NC42 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RNF149Q8NC42 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RNF149Q8NC42 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RNF149Q8NC42 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RNF149Q8NC42 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RNF149Q8NC42 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RNF149Q8NC42 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RNF149Q8NC42 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
RNF149Q8NC42 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RNF149Q8NC42 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RNF149Q8NC42 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RNF149Q8NC42 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RNF149Q8NC42 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RNF149Q8NC42 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RNF149Q8NC42 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RNF149Q8NC42 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
RNF149Q8NC42 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RNF149Q8NC42 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RNF149Q8NC42 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RNF149Q8NC42 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RNF149Q8NC42 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RNF149Q8NC42 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RNF149Q8NC42 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RNF149Q8NC42 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RNF149Q8NC42 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RNF149Q8NC42 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RNF149Q8NC42 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RNF149Q8NC42 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RNF149Q8NC42 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RNF149Q8NC42 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RNF149Q8NC42 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RNF149Q8NC42 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RNF149Q8NC42 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RNF149Q8NC42 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RNF149Q8NC42 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RNF149Q8NC42 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RNF149Q8NC42 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RNF149Q8NC42 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
RNF149Q8NC42 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RNF149Q8NC42 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RNF149Q8NC42 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RNF149Q8NC42 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RNF149Q8NC42 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RNF149Q8NC42 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RNF149Q8NC42 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RNF149Q8NC42 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RNF149Q8NC42 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RNF149Q8NC42 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RNF149Q8NC42 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RNF149Q8NC42 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RNF149Q8NC42 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
RNF149Q8NC42 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RNF149Q8NC42 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RNF149Q8NC42 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RNF149Q8NC42 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RNF149Q8NC42 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RNF149Q8NC42 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
RNF149Q8NC42 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RNF149Q8NC42 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RNF149Q8NC42 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RNF149Q8NC42 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RNF149Q8NC42 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RNF149Q8NC42 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RNF149Q8NC42 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RNF149Q8NC42 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RNF149Q8NC42 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RNF149Q8NC42 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RNF149Q8NC42 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
RNF149Q8NC42 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RNF149Q8NC42 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RNF149Q8NC42 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RNF149Q8NC42 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms