Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9U0

TC2N, Tandem C2 domains nuclear protein, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TC2NQ8N9U0 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TC2NQ8N9U0 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TC2NQ8N9U0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TC2NQ8N9U0 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TC2NQ8N9U0 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TC2NQ8N9U0 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TC2NQ8N9U0 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TC2NQ8N9U0 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TC2NQ8N9U0 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TC2NQ8N9U0 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TC2NQ8N9U0 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TC2NQ8N9U0 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TC2NQ8N9U0 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TC2NQ8N9U0 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TC2NQ8N9U0 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TC2NQ8N9U0 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TC2NQ8N9U0 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TC2NQ8N9U0 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TC2NQ8N9U0 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TC2NQ8N9U0 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TC2NQ8N9U0 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TC2NQ8N9U0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TC2NQ8N9U0 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TC2NQ8N9U0 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TC2NQ8N9U0 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TC2NQ8N9U0 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TC2NQ8N9U0 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TC2NQ8N9U0 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TC2NQ8N9U0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TC2NQ8N9U0 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TC2NQ8N9U0 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TC2NQ8N9U0 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TC2NQ8N9U0 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TC2NQ8N9U0 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TC2NQ8N9U0 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TC2NQ8N9U0 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TC2NQ8N9U0 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TC2NQ8N9U0 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TC2NQ8N9U0 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TC2NQ8N9U0 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TC2NQ8N9U0 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TC2NQ8N9U0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TC2NQ8N9U0 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TC2NQ8N9U0 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TC2NQ8N9U0 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TC2NQ8N9U0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TC2NQ8N9U0 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TC2NQ8N9U0 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TC2NQ8N9U0 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TC2NQ8N9U0 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TC2NQ8N9U0 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TC2NQ8N9U0 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TC2NQ8N9U0 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TC2NQ8N9U0 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TC2NQ8N9U0 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TC2NQ8N9U0 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TC2NQ8N9U0 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TC2NQ8N9U0 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TC2NQ8N9U0 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TC2NQ8N9U0 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TC2NQ8N9U0 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TC2NQ8N9U0 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TC2NQ8N9U0 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TC2NQ8N9U0 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TC2NQ8N9U0 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TC2NQ8N9U0 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TC2NQ8N9U0 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TC2NQ8N9U0 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TC2NQ8N9U0 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TC2NQ8N9U0 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TC2NQ8N9U0 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TC2NQ8N9U0 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TC2NQ8N9U0 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TC2NQ8N9U0 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TC2NQ8N9U0 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TC2NQ8N9U0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TC2NQ8N9U0 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TC2NQ8N9U0 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TC2NQ8N9U0 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TC2NQ8N9U0 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TC2NQ8N9U0 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TC2NQ8N9U0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TC2NQ8N9U0 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TC2NQ8N9U0 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TC2NQ8N9U0 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TC2NQ8N9U0 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TC2NQ8N9U0 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TC2NQ8N9U0 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TC2NQ8N9U0 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TC2NQ8N9U0 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TC2NQ8N9U0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TC2NQ8N9U0 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TC2NQ8N9U0 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TC2NQ8N9U0 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TC2NQ8N9U0 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TC2NQ8N9U0 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TC2NQ8N9U0 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TC2NQ8N9U0 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TC2NQ8N9U0 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TC2NQ8N9U0 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.2 ms