Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7C7

RNF148, RING finger protein 148, humanhuman

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Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF148Q8N7C7 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
RNF148Q8N7C7 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RNF148Q8N7C7 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RNF148Q8N7C7 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RNF148Q8N7C7 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
RNF148Q8N7C7 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RNF148Q8N7C7 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RNF148Q8N7C7 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RNF148Q8N7C7 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RNF148Q8N7C7 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RNF148Q8N7C7 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RNF148Q8N7C7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RNF148Q8N7C7 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RNF148Q8N7C7 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RNF148Q8N7C7 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RNF148Q8N7C7 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RNF148Q8N7C7 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RNF148Q8N7C7 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RNF148Q8N7C7 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RNF148Q8N7C7 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RNF148Q8N7C7 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RNF148Q8N7C7 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RNF148Q8N7C7 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RNF148Q8N7C7 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RNF148Q8N7C7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RNF148Q8N7C7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RNF148Q8N7C7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
RNF148Q8N7C7 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RNF148Q8N7C7 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RNF148Q8N7C7 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RNF148Q8N7C7 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RNF148Q8N7C7 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RNF148Q8N7C7 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RNF148Q8N7C7 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RNF148Q8N7C7 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RNF148Q8N7C7 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RNF148Q8N7C7 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RNF148Q8N7C7 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RNF148Q8N7C7 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RNF148Q8N7C7 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
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RNF148Q8N7C7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
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RNF148Q8N7C7 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
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RNF148Q8N7C7 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
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RNF148Q8N7C7 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
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RNF148Q8N7C7 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RNF148Q8N7C7 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RNF148Q8N7C7 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RNF148Q8N7C7 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
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RNF148Q8N7C7 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
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RNF148Q8N7C7 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
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RNF148Q8N7C7 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RNF148Q8N7C7 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RNF148Q8N7C7 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RNF148Q8N7C7 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RNF148Q8N7C7 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RNF148Q8N7C7 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RNF148Q8N7C7 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RNF148Q8N7C7 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RNF148Q8N7C7 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RNF148Q8N7C7 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RNF148Q8N7C7 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RNF148Q8N7C7 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RNF148Q8N7C7 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RNF148Q8N7C7 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RNF148Q8N7C7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RNF148Q8N7C7 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RNF148Q8N7C7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RNF148Q8N7C7 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RNF148Q8N7C7 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RNF148Q8N7C7 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RNF148Q8N7C7 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RNF148Q8N7C7 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RNF148Q8N7C7 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RNF148Q8N7C7 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RNF148Q8N7C7 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RNF148Q8N7C7 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RNF148Q8N7C7 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RNF148Q8N7C7 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
RNF148Q8N7C7 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RNF148Q8N7C7 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RNF148Q8N7C7 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
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