Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWZ4

TRIM48, Tripartite motif-containing protein 48, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM48Q8IWZ4 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM48Q8IWZ4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM48Q8IWZ4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM48Q8IWZ4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM48Q8IWZ4 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM48Q8IWZ4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM48Q8IWZ4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM48Q8IWZ4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM48Q8IWZ4 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM48Q8IWZ4 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM48Q8IWZ4 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM48Q8IWZ4 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM48Q8IWZ4 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM48Q8IWZ4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM48Q8IWZ4 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM48Q8IWZ4 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM48Q8IWZ4 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM48Q8IWZ4 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM48Q8IWZ4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM48Q8IWZ4 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM48Q8IWZ4 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM48Q8IWZ4 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM48Q8IWZ4 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM48Q8IWZ4 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
TRIM48Q8IWZ4 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM48Q8IWZ4 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM48Q8IWZ4 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM48Q8IWZ4 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM48Q8IWZ4 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM48Q8IWZ4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM48Q8IWZ4 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM48Q8IWZ4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM48Q8IWZ4 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM48Q8IWZ4 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM48Q8IWZ4 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM48Q8IWZ4 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM48Q8IWZ4 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM48Q8IWZ4 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM48Q8IWZ4 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM48Q8IWZ4 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM48Q8IWZ4 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM48Q8IWZ4 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM48Q8IWZ4 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM48Q8IWZ4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM48Q8IWZ4 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM48Q8IWZ4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM48Q8IWZ4 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM48Q8IWZ4 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM48Q8IWZ4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM48Q8IWZ4 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM48Q8IWZ4 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM48Q8IWZ4 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM48Q8IWZ4 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM48Q8IWZ4 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM48Q8IWZ4 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM48Q8IWZ4 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM48Q8IWZ4 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM48Q8IWZ4 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM48Q8IWZ4 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM48Q8IWZ4 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM48Q8IWZ4 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM48Q8IWZ4 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM48Q8IWZ4 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM48Q8IWZ4 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM48Q8IWZ4 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM48Q8IWZ4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM48Q8IWZ4 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM48Q8IWZ4 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM48Q8IWZ4 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM48Q8IWZ4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM48Q8IWZ4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM48Q8IWZ4 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM48Q8IWZ4 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM48Q8IWZ4 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM48Q8IWZ4 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM48Q8IWZ4 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM48Q8IWZ4 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
TRIM48Q8IWZ4 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM48Q8IWZ4 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM48Q8IWZ4 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM48Q8IWZ4 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM48Q8IWZ4 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM48Q8IWZ4 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM48Q8IWZ4 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM48Q8IWZ4 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM48Q8IWZ4 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM48Q8IWZ4 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM48Q8IWZ4 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM48Q8IWZ4 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM48Q8IWZ4 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM48Q8IWZ4 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM48Q8IWZ4 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM48Q8IWZ4 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM48Q8IWZ4 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM48Q8IWZ4 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM48Q8IWZ4 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM48Q8IWZ4 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM48Q8IWZ4 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM48Q8IWZ4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM48Q8IWZ4 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms