Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUI4

SNX29P2, Putative protein SNX29P2, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29P2Q8IUI4 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX29P2Q8IUI4 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX29P2Q8IUI4 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX29P2Q8IUI4 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX29P2Q8IUI4 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX29P2Q8IUI4 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX29P2Q8IUI4 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX29P2Q8IUI4 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX29P2Q8IUI4 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX29P2Q8IUI4 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX29P2Q8IUI4 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX29P2Q8IUI4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX29P2Q8IUI4 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX29P2Q8IUI4 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX29P2Q8IUI4 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX29P2Q8IUI4 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX29P2Q8IUI4 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX29P2Q8IUI4 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX29P2Q8IUI4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX29P2Q8IUI4 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX29P2Q8IUI4 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX29P2Q8IUI4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX29P2Q8IUI4 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX29P2Q8IUI4 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX29P2Q8IUI4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX29P2Q8IUI4 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX29P2Q8IUI4 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX29P2Q8IUI4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX29P2Q8IUI4 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX29P2Q8IUI4 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX29P2Q8IUI4 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX29P2Q8IUI4 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX29P2Q8IUI4 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX29P2Q8IUI4 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX29P2Q8IUI4 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX29P2Q8IUI4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX29P2Q8IUI4 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX29P2Q8IUI4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX29P2Q8IUI4 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX29P2Q8IUI4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX29P2Q8IUI4 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX29P2Q8IUI4 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX29P2Q8IUI4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX29P2Q8IUI4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX29P2Q8IUI4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX29P2Q8IUI4 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX29P2Q8IUI4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX29P2Q8IUI4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX29P2Q8IUI4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX29P2Q8IUI4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX29P2Q8IUI4 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX29P2Q8IUI4 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX29P2Q8IUI4 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX29P2Q8IUI4 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX29P2Q8IUI4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX29P2Q8IUI4 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX29P2Q8IUI4 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX29P2Q8IUI4 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX29P2Q8IUI4 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX29P2Q8IUI4 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX29P2Q8IUI4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX29P2Q8IUI4 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX29P2Q8IUI4 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX29P2Q8IUI4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX29P2Q8IUI4 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX29P2Q8IUI4 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX29P2Q8IUI4 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX29P2Q8IUI4 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX29P2Q8IUI4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX29P2Q8IUI4 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX29P2Q8IUI4 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX29P2Q8IUI4 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX29P2Q8IUI4 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX29P2Q8IUI4 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX29P2Q8IUI4 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX29P2Q8IUI4 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SNX29P2Q8IUI4 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SNX29P2Q8IUI4 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX29P2Q8IUI4 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX29P2Q8IUI4 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX29P2Q8IUI4 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX29P2Q8IUI4 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX29P2Q8IUI4 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX29P2Q8IUI4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX29P2Q8IUI4 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX29P2Q8IUI4 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX29P2Q8IUI4 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX29P2Q8IUI4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX29P2Q8IUI4 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX29P2Q8IUI4 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX29P2Q8IUI4 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX29P2Q8IUI4 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX29P2Q8IUI4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX29P2Q8IUI4 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX29P2Q8IUI4 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX29P2Q8IUI4 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX29P2Q8IUI4 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX29P2Q8IUI4 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX29P2Q8IUI4 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX29P2Q8IUI4 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms