Protein–RNA interactions for Protein: Q86YI8

PHF13, PHD finger protein 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF13Q86YI8 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PHF13Q86YI8 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PHF13Q86YI8 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PHF13Q86YI8 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PHF13Q86YI8 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PHF13Q86YI8 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PHF13Q86YI8 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PHF13Q86YI8 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PHF13Q86YI8 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PHF13Q86YI8 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PHF13Q86YI8 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PHF13Q86YI8 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PHF13Q86YI8 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PHF13Q86YI8 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PHF13Q86YI8 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PHF13Q86YI8 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PHF13Q86YI8 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PHF13Q86YI8 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PHF13Q86YI8 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PHF13Q86YI8 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PHF13Q86YI8 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PHF13Q86YI8 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PHF13Q86YI8 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PHF13Q86YI8 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PHF13Q86YI8 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PHF13Q86YI8 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PHF13Q86YI8 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PHF13Q86YI8 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PHF13Q86YI8 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PHF13Q86YI8 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PHF13Q86YI8 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PHF13Q86YI8 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PHF13Q86YI8 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PHF13Q86YI8 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PHF13Q86YI8 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PHF13Q86YI8 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PHF13Q86YI8 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PHF13Q86YI8 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PHF13Q86YI8 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PHF13Q86YI8 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PHF13Q86YI8 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PHF13Q86YI8 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PHF13Q86YI8 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PHF13Q86YI8 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PHF13Q86YI8 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PHF13Q86YI8 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PHF13Q86YI8 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PHF13Q86YI8 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PHF13Q86YI8 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PHF13Q86YI8 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PHF13Q86YI8 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PHF13Q86YI8 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PHF13Q86YI8 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PHF13Q86YI8 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PHF13Q86YI8 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PHF13Q86YI8 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PHF13Q86YI8 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PHF13Q86YI8 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PHF13Q86YI8 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PHF13Q86YI8 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PHF13Q86YI8 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PHF13Q86YI8 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PHF13Q86YI8 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PHF13Q86YI8 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PHF13Q86YI8 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PHF13Q86YI8 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PHF13Q86YI8 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PHF13Q86YI8 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PHF13Q86YI8 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PHF13Q86YI8 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PHF13Q86YI8 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PHF13Q86YI8 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PHF13Q86YI8 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PHF13Q86YI8 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PHF13Q86YI8 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PHF13Q86YI8 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PHF13Q86YI8 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PHF13Q86YI8 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PHF13Q86YI8 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PHF13Q86YI8 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PHF13Q86YI8 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PHF13Q86YI8 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PHF13Q86YI8 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PHF13Q86YI8 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PHF13Q86YI8 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PHF13Q86YI8 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PHF13Q86YI8 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PHF13Q86YI8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PHF13Q86YI8 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PHF13Q86YI8 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PHF13Q86YI8 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PHF13Q86YI8 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PHF13Q86YI8 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PHF13Q86YI8 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PHF13Q86YI8 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PHF13Q86YI8 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PHF13Q86YI8 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PHF13Q86YI8 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PHF13Q86YI8 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PHF13Q86YI8 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms