Protein–RNA interactions for Protein: Q86YC2

PALB2, Partner and localizer of BRCA2, humanhuman

Predictions only

Length 1,186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALB2Q86YC2 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PALB2Q86YC2 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PALB2Q86YC2 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PALB2Q86YC2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PALB2Q86YC2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PALB2Q86YC2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PALB2Q86YC2 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PALB2Q86YC2 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PALB2Q86YC2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PALB2Q86YC2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PALB2Q86YC2 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PALB2Q86YC2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PALB2Q86YC2 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PALB2Q86YC2 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PALB2Q86YC2 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PALB2Q86YC2 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PALB2Q86YC2 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PALB2Q86YC2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PALB2Q86YC2 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PALB2Q86YC2 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PALB2Q86YC2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PALB2Q86YC2 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PALB2Q86YC2 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PALB2Q86YC2 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PALB2Q86YC2 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PALB2Q86YC2 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PALB2Q86YC2 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PALB2Q86YC2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PALB2Q86YC2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PALB2Q86YC2 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PALB2Q86YC2 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PALB2Q86YC2 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PALB2Q86YC2 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PALB2Q86YC2 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PALB2Q86YC2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PALB2Q86YC2 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PALB2Q86YC2 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PALB2Q86YC2 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PALB2Q86YC2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PALB2Q86YC2 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PALB2Q86YC2 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PALB2Q86YC2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PALB2Q86YC2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PALB2Q86YC2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PALB2Q86YC2 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PALB2Q86YC2 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PALB2Q86YC2 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PALB2Q86YC2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PALB2Q86YC2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PALB2Q86YC2 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PALB2Q86YC2 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PALB2Q86YC2 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PALB2Q86YC2 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PALB2Q86YC2 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PALB2Q86YC2 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PALB2Q86YC2 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PALB2Q86YC2 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PALB2Q86YC2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PALB2Q86YC2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PALB2Q86YC2 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PALB2Q86YC2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PALB2Q86YC2 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PALB2Q86YC2 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PALB2Q86YC2 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PALB2Q86YC2 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PALB2Q86YC2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PALB2Q86YC2 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PALB2Q86YC2 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PALB2Q86YC2 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PALB2Q86YC2 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PALB2Q86YC2 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PALB2Q86YC2 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PALB2Q86YC2 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PALB2Q86YC2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PALB2Q86YC2 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PALB2Q86YC2 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PALB2Q86YC2 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PALB2Q86YC2 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PALB2Q86YC2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PALB2Q86YC2 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PALB2Q86YC2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PALB2Q86YC2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PALB2Q86YC2 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PALB2Q86YC2 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PALB2Q86YC2 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PALB2Q86YC2 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PALB2Q86YC2 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PALB2Q86YC2 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PALB2Q86YC2 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PALB2Q86YC2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PALB2Q86YC2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PALB2Q86YC2 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PALB2Q86YC2 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PALB2Q86YC2 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PALB2Q86YC2 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PALB2Q86YC2 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PALB2Q86YC2 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PALB2Q86YC2 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PALB2Q86YC2 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PALB2Q86YC2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms