Protein–RNA interactions for Protein: Q86W92

PPFIBP1, Liprin-beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIBP1Q86W92 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PPFIBP1Q86W92 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PPFIBP1Q86W92 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PPFIBP1Q86W92 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PPFIBP1Q86W92 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PPFIBP1Q86W92 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PPFIBP1Q86W92 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PPFIBP1Q86W92 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PPFIBP1Q86W92 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PPFIBP1Q86W92 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PPFIBP1Q86W92 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PPFIBP1Q86W92 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PPFIBP1Q86W92 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PPFIBP1Q86W92 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PPFIBP1Q86W92 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PPFIBP1Q86W92 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PPFIBP1Q86W92 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PPFIBP1Q86W92 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PPFIBP1Q86W92 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PPFIBP1Q86W92 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PPFIBP1Q86W92 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PPFIBP1Q86W92 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PPFIBP1Q86W92 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPFIBP1Q86W92 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPFIBP1Q86W92 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPFIBP1Q86W92 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPFIBP1Q86W92 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPFIBP1Q86W92 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PPFIBP1Q86W92 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PPFIBP1Q86W92 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PPFIBP1Q86W92 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PPFIBP1Q86W92 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PPFIBP1Q86W92 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PPFIBP1Q86W92 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PPFIBP1Q86W92 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PPFIBP1Q86W92 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPFIBP1Q86W92 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPFIBP1Q86W92 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPFIBP1Q86W92 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPFIBP1Q86W92 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPFIBP1Q86W92 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPFIBP1Q86W92 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPFIBP1Q86W92 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PPFIBP1Q86W92 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPFIBP1Q86W92 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPFIBP1Q86W92 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPFIBP1Q86W92 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPFIBP1Q86W92 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPFIBP1Q86W92 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPFIBP1Q86W92 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPFIBP1Q86W92 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPFIBP1Q86W92 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPFIBP1Q86W92 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPFIBP1Q86W92 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPFIBP1Q86W92 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPFIBP1Q86W92 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPFIBP1Q86W92 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPFIBP1Q86W92 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPFIBP1Q86W92 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPFIBP1Q86W92 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPFIBP1Q86W92 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPFIBP1Q86W92 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPFIBP1Q86W92 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPFIBP1Q86W92 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPFIBP1Q86W92 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPFIBP1Q86W92 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPFIBP1Q86W92 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PPFIBP1Q86W92 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PPFIBP1Q86W92 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PPFIBP1Q86W92 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PPFIBP1Q86W92 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PPFIBP1Q86W92 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PPFIBP1Q86W92 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PPFIBP1Q86W92 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PPFIBP1Q86W92 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PPFIBP1Q86W92 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PPFIBP1Q86W92 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PPFIBP1Q86W92 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PPFIBP1Q86W92 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PPFIBP1Q86W92 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PPFIBP1Q86W92 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PPFIBP1Q86W92 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PPFIBP1Q86W92 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PPFIBP1Q86W92 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PPFIBP1Q86W92 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PPFIBP1Q86W92 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PPFIBP1Q86W92 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PPFIBP1Q86W92 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PPFIBP1Q86W92 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PPFIBP1Q86W92 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PPFIBP1Q86W92 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PPFIBP1Q86W92 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PPFIBP1Q86W92 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PPFIBP1Q86W92 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PPFIBP1Q86W92 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PPFIBP1Q86W92 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PPFIBP1Q86W92 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PPFIBP1Q86W92 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PPFIBP1Q86W92 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PPFIBP1Q86W92 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms